RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519076.5

TRPS1-208, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TRPS1, Length 3,329 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-208ENST00000519076 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RPS6KC1Q96S38 1066 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 HAPLN2Q9GZV7 340 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MIS12Q9H081 205 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SNTG2Q9NY99 539 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NOP53Q9NZM5 478 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DKK3Q9UBP4 350 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NR2E1Q9Y466 385 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MCM3APO60318 1980 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EVPLQ92817 2033 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATAD5Q96QE3 1844 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TBKBP1A7MCY6 615 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EDN1P05305 212 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RARBP10826 455 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RALAP11233 206 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATF2P15336 505 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATICP31939 592 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ATP11AP98196 1134 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 POU5F1Q01860 360 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IQSEC1Q6DN90 963 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RUFY4Q6ZNE9 571 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EMC1Q8N766 993 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FEZF2Q8TBJ5 459 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SNX27Q96L92 541 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZIM3Q96PE6 472 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MRPL46Q9H2W6 279 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DPP3Q9NY33 737 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IP6K2Q9UHH9 426 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TNFSF13BQ9Y275 285 aa8.23□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RRN3P2A6NIE6 340 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 A8MXQ7 604 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SGK1O00141 431 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SYF2O95926 243 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CFHP08603 1231 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GNGT1P63211 74 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ALS2CLQ60I27 953 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C11orf63Q6NUN7 778 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 BEST2Q8NFU1 509 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NDNQ99608 321 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SNX25Q9H3E2 840 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NOD2Q9HC29 1040 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 COMMD8Q9NX08 183 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IKBKGQ9Y6K9 419 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NCANO14594 1321 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DOCK1Q14185 1865 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TRIM43BA6NCK2 446 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PODXLO00592 558 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PHF2O75151 1096 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 C22orf31O95567 290 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACSL3O95573 720 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT10P13645 584 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FUT4P22083 530 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 POLE2P56282 527 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FKBP1BP68106 108 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MCL1Q07820 350 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 IRF5Q13568 498 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CFAP157Q5JU67 520 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CYP4F22Q6NT55 531 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NOTUMQ6P988 496 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 CCDC89Q8N998 374 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ANKRD27Q96NW4 1050 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ERP44Q9BS26 406 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 EIF2AQ9BY44 585 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SMYD3Q9H7B4 428 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 DOCK5Q9H7D0 1870 aa8.22□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 GOLGA8KD6RF30 607 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 LGR5O75473 907 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MMP3P08254 477 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ADORA2BP29275 332 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 SLC1A1P43005 524 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PMS2P54278 862 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NOMO3P69849 1222 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KRT17Q04695 432 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MBTD1Q05BQ5 628 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 MAP2K5Q13163 448 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 PSME4Q14997 1843 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 ACOT1Q86TX2 421 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 KCTD6Q8NC69 237 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 NPLOC4Q8TAT6 608 aa8.21□□□□□ -1.09
TRPS1-208ENST00000519076 FBXO25Q8TCJ0 367 aa8.21□□□□□ -1.09
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