RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502484.6

PDE4D-208, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,478 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-208ENST00000502484 ARHGAP17Q68EM7 881 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LHX8Q68G74 356 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LIMS2Q7Z4I7 341 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCDC89Q8N998 374 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ARRDC4Q8NCT1 418 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 STK32AQ8WU08 396 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC35F5Q8WV83 523 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC4A5Q9BY07 1137 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SPC25Q9HBM1 224 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 XPNPEP3Q9NQH7 507 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRPV2Q9Y5S1 764 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 C2CD4BA6NLJ0 364 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SPTLC1O15269 473 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RNF8O76064 485 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PGK1P00558 417 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ATF2P15336 505 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GPD1P21695 349 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KLRC2P26717 231 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LRPAP1P30533 357 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TAF6P49848 677 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TWF2Q6IBS0 349 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 OR6B2Q6IFH4 312 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PMF1Q6P1K2 205 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CXCL17Q6UXB2 119 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KDM7AQ6ZMT4 941 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZNF365Q70YC5 407 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TMEM110Q86TL2 294 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CRYBG2Q8N1P7 616 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SH2D3CQ8N5H7 860 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 BBOF1Q8ND07 529 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ABHD8Q96I13 439 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM118BQ9BPY3 351 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DPEP3Q9H4B8 488 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RNF19AQ9NV58 838 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 HESX1Q9UBX0 185 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DNPEPQ9ULA0 475 aa8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DRG1Q9Y295 367 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 A8MXQ7 604 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TULP2O00295 520 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PTGESO14684 152 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ADAMTS4O75173 837 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RPLP2P05387 115 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KDELR1P24390 212 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 MIPP30301 263 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ACTN2P35609 894 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ITGA8P53708 1063 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 OASLQ15646 514 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SMTNL2Q2TAL5 461 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SV2CQ496J9 727 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 KCNT1Q5JUK3 1230 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DENND2CQ68D51 928 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRNP1Q6NT89 227 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 OLFML1Q6UWY5 402 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RPAINQ86UA6 219 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RSPH3Q86UC2 560 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SERINC5Q86VE9 423 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CCHCR1Q8TD31 782 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 CNPY3Q9BT09 278 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SEMA4AQ9H3S1 761 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZWILCHQ9H900 591 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 AAASQ9NRG9 546 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FAM49BQ9NUQ9 324 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 USP18Q9UMW8 372 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 A6NNZ2 444 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PIK3R2O00459 728 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 DPYSL4O14531 572 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RIPK2O43353 540 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RPS6KA5O75582 802 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 FGFR1P11362 822 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 NR1D1P20393 614 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ADCY8P40145 1251 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RPL34P49207 117 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 RGS7P49802 495 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SNX16P57768 344 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 LILRA4P59901 499 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SLC6A3Q01959 620 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 PDE4CQ08493 712 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TUBB8Q3ZCM7 444 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 SESTD1Q86VW0 696 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 ALLCQ8N6M5 410 aa8.6□□□□□ -1.03
PDE4D-208ENST00000502484 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.6□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.1 ms