RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 MEI1Q5TIA1 1274 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 KIAA0319Q5VV43 1072 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF2Q6P1X5 1199 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 EMBQ6PCB8 327 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF410Q86VK4 478 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 KSR1Q8IVT5 923 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 IFT20Q8IY31 132 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 POU5F2Q8N7G0 328 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 TMEM161BQ8NDZ6 487 aa5.97□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAJB3Q8WWF6 145 aa5.97□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TAF4BQ92750 862 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 CAVIN3Q969G5 261 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 SNX27Q96L92 541 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 NLRP4Q96MN2 994 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 CEP89Q96ST8 783 aa5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
ARHGEF3-215ENST00000498517 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP5.97□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 NPHS2Q9NP85 383 aa5.97□□□□□ -1.45
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP5.96□□□□□ -1.46
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ARHGEF3-215ENST00000498517 GBP6Q6ZN66 633 aa5.96□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 CATSPER4Q7RTX7 472 aa5.96□□□□□ -1.46
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ARHGEF3-215ENST00000498517 RUFY1Q96T51 708 aa5.96□□□□□ -1.46
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ARHGEF3-215ENST00000498517 PCIF1Q9H4Z3 704 aa5.96□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GDF3Q9NR23 364 aa5.96□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 EHD2Q9NZN4 543 aa5.96□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa5.96□□□□□ -1.46
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa5.96□□□□□ -1.46
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ARHGEF3-215ENST00000498517 MROH7Q68CQ1 1323 aa5.96□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 A0A1W2PQY0 241 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 MBLAC1A4D2B0 266 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6CA6NDK9 693 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ZNF233A6NK53 670 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 DCDC2CA8MYV0 355 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 AGPSO00116 658 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ARVCFO00192 962 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 TGFB1I1O43294 461 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GFPT2O94808 682 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 FTCDO95954 541 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GJB1P08034 283 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 GOLGA6DP0CG33 693 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 ACTN1P12814 892 aa5.95□□□□□ -1.46
ARHGEF3-215ENST00000498517 UCHL3P15374 230 aa5.95□□□□□ -1.46
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