RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492723.1

TOM1-216, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 2

Gene TOM1, Length 2,568 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-216ENST00000492723 CST8O60676 142 aa17.56■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 KPNA6O60684 536 aa17.56■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 FGFR1P11362 822 aa17.56■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 CDO1Q16878 200 aa17.56■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP17.56■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 ACTL9Q8TC94 416 aa17.55■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 TSPAN18Q96SJ8 248 aa17.55■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 ITGAVP06756 1048 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 MDH1P40925 334 aaKnown RBP17.54■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 BBS12Q6ZW61 710 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TMEM110Q86TL2 294 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 SLC35B2Q8TB61 432 aa17.54■□□□□ 0.4
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TOM1-216ENST00000492723 FLT3LGP49771 235 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PPP2R2AP63151 447 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 GPS1Q13098 491 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 CCDC14Q49A88 953 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 FOXR1Q6PIV2 292 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TLCD1Q96CP7 247 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 TRPV2Q9Y5S1 764 aa17.54■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 PRPSAP2O60256 369 aa17.53■□□□□ 0.4
TOM1-216ENST00000492723 GABBR2O75899 941 aa17.53■□□□□ 0.4
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