RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486229.5

NBPF3-212, Transcript of NBPF member 3, humanhuman

TSL 3

Gene NBPF3, Length 933 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3-212ENST00000486229 VPS36Q86VN1 386 aa24.14■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 HLA-CQ95604 372 aa24.14■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP24.14■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 IMPACTQ9P2X3 320 aa24.14■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 M0QYV0 167 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CLDN5O00501 218 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 AP5Z1O43299 807 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PAPLNO95428 1278 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 VNN2O95498 520 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 GLP2RO95838 553 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CASP14P31944 242 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 SLC47A2Q86VL8 602 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 MSANTD4Q8NCY6 345 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 OR8K1Q8NGG5 319 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 RIPOR3Q96MK2 946 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 MUC6Q6W4X9 2439 aa24.13■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PTPN2P17706 415 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 ARID5AQ03989 594 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 ATAT1Q5SQI0 421 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PAQR9Q6ZVX9 377 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 VN1R2Q8NFZ6 395 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 EPS8L1Q8TE68 723 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TFAP2BQ92481 460 aa24.12■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 MIS12Q9H081 205 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 LHX5Q9H2C1 402 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 FBXO44Q9H4M3 255 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CD207Q9UJ71 328 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 FAM50BQ9Y247 325 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 BRWD1Q9NSI6 2320 aa24.12■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 F8VP50 259 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 LINC01565O15544 149 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 MICAL2O94851 1124 aa24.11■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 MTHFRP42898 656 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 MAP3K7CLP57077 242 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CDR2Q01850 454 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 KLHL30Q0D2K2 578 aa24.11■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 TMEM35BQ8NCS4 154 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PSMG2Q969U7 264 aa24.11■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 ADAM7Q9H2U9 754 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CRISPLD1Q9H336 500 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CYLDQ9NQC7 956 aa24.11■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP24.1■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 TTC9BQ8N6N2 239 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 STK32AQ8WU08 396 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 HSFY1Q96LI6 401 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 GCNAQ96QF7 691 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 ASAH2Q9NR71 780 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 CLEC1BQ9P126 229 aa24.1■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 ZNF197O14709 1029 aa24.09■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 MFAP3LO75121 409 aa24.09■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TBX10O75333 385 aa24.09■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 SERPING1P05155 500 aa24.09■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 ATF6P18850 670 aa24.09■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PLA2G4AP47712 749 aa24.09■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PPP3CCP48454 512 aa24.09■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
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NBPF3-212ENST00000486229 ARID5BQ14865 1188 aa24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 PKDCCQ504Y2 493 aa24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 SYCE2Q6PIF2 218 aa24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TMC5Q6UXY8 1006 aa24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
NBPF3-212ENST00000486229 TTC30AQ86WT1 665 aa24.08■■□□□ 1.45
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