RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458625.5

CCL25-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 25, human

TSL 5

Gene CCL25, Length 744 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CCL25-204	ENST00000458625	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ATXN1L	P0C7T5	689 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ITPKB	P27987	946 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SMARCB1	Q12824	385 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	GRIK2	Q13002	908 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	DHCR24	Q15392	516 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PLEKHG6	Q3KR16	790 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	HSF5	Q4G112	596 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	EOGT	Q5NDL2	527 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	HAUS3	Q68CZ6	603 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SCARA3	Q6AZY7	606 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	RHBDF2	Q6PJF5	856 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	FILIP1	Q7Z7B0	1213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	NECAB1	Q8N987	351 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PIP4K2C	Q8TBX8	421 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SPATA18	Q8TC71	538 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	WASF1	Q92558	559 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ERLEC1	Q96DZ1	483 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	FAM212A	Q96EL1	285 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PNKP	Q96T60	521 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PKMYT1	Q99640	499 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	C17orf75	Q9HAS0	396 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CD248	Q9HCU0	757 aa		12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	KIAA1522	Q9P206	1035 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	GTF3C5	Q9Y5Q8	519 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MUC22	E2RYF6	1773 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PLS3	P13797	630 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	HDC	P19113	662 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MAOB	P27338	520 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	METTL23	Q86XA0	190 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MIB1	Q86YT6	1006 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	THEM5	Q8N1Q8	247 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PRORY	Q9H606	182 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	LRWD1	Q9UFC0	647 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	KNL1	Q8NG31	2342 aa		12.82	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SPTA1	P02549	2419 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625		A0A1W2PQF6	199 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MYMK	A6NI61	221 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	OGT	O15294	1046 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	HCRT	O43612	131 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	JAK2	O60674	1132 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	APOD	P05090	189 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	NDUFV2	P19404	249 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PAX3	P23760	479 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	FXR2	P51116	673 aa	Known RBP eCLIP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	BNC1	Q01954	994 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	KCNB1	Q14721	858 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SLC39A4	Q6P5W5	647 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PCSK4	Q6UW60	755 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ZNF605	Q86T29	641 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	NSUN7	Q8NE18	718 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SNX29	Q8TEQ0	813 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ZNF419	Q96HQ0	510 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	MMTAG2	Q9BU76	263 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	RNF38	Q9H0F5	515 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SLC6A17	Q9H1V8	727 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ARHGEF4	Q9NR80	690 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CYP8B1	Q9UNU6	501 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	DNM3	Q9UQ16	869 aa		12.81	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	COL12A1	Q99715	3063 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625		A0A0B4J269	797 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	TRIM24	O15164	1050 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	GUCY2C	P25092	1073 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CDC25A	P30304	524 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	EIF2D	P41214	584 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	GRIA2	P42262	883 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	WAS	P42768	502 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	TNFRSF4	P43489	277 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ABCG1	P45844	678 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	TAF6	P49848	677 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	REST	Q13127	1097 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PDIA5	Q14554	519 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	BICD1	Q96G01	975 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PNMA5	Q96PV4	448 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	TSPAN18	Q96SJ8	248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	PRDM16	Q9HAZ2	1276 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	ABCB6	Q9NP58	842 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	12.8	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	CABIN1	Q9Y6J0	2220 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	GOLGA8CP	A6NN73	597 aa		12.79	□□□□□ -0.36
CCL25-204	ENST00000458625	KPNA7	A9QM74	516 aa		12.79	□□□□□ -0.36

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