RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449508.1

TOM1-211, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, humanhuman

TSL 4

Gene TOM1, Length 593 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOM1-211ENST00000449508 HRO43593 1189 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 STAU1O95793 577 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PFKFB1P16118 471 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CNR2P34972 360 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 GJA4P35212 333 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 IFNAR2P48551 515 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PDE6CP51160 858 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 AP3M2P53677 418 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF77Q15935 545 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 FSTL4Q6MZW2 842 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CPA6Q8N4T0 437 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PLEKHO2Q8TD55 490 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 EXOC4Q96A65 974 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CHFRQ96EP1 664 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 C8orf48Q96LL4 319 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 XYLT2Q9H1B5 865 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DPEP3Q9H4B8 488 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ECT2Q9H8V3 914 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 USP25Q9UHP3 1055 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 USP18Q9UMW8 372 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 WNT6Q9Y6F9 365 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CACNA1AO00555 2505 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa14.61□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ATG13O75143 517 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ABL1P00519 1130 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HOXC13P31276 330 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CDH8P55286 799 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 NOP14P78316 857 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KRT85P78386 507 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 NR1H3Q13133 447 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF667Q5HYK9 610 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 LAIR1Q6GTX8 287 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PKN3Q6P5Z2 889 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ATP2A3Q93084 1043 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 LINC00597Q9H2U6 94 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DMAC2Q9NW81 257 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HELZP42694 1942 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DCHS1Q96JQ0 3298 aa14.6□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CLDN5O00501 218 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PDXKO00764 312 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 EGFP01133 1207 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MYL1P05976 194 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 DRD1P21728 446 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HOXA6P31267 233 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 PPP3CCP48454 512 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CLDN10P78369 228 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 USP4Q13107 963 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 NCOA4Q13772 614 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF699Q32M78 642 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 EML3Q32P44 896 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CEP68Q76N32 757 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SLC9A9Q8IVB4 645 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 CHAMP1Q96JM3 812 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SMYD3Q9H7B4 428 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 VRTNQ9H8Y1 702 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SLC8A2Q9UPR5 921 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 HPSEQ9Y251 543 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.59□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 SDK1Q7Z5N4 2213 aa14.58□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 MYH10P35580 1976 aa14.58□□□□□ -0.07
TOM1-211ENST00000449508 ZNF840PA6NDX5 716 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 RNF40O75150 1001 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 VNN1O95497 513 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 NR3C1P04150 777 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 RPN1P04843 607 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 RETP07949 1114 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 TCF3P15923 654 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 PFKLP17858 780 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 TGM1P22735 817 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 SYKP43405 635 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 RAP1GAPP47736 663 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 CACNA2D1P54289 1103 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 DLG4P78352 724 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 ARHGAP8P85298 464 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 SPEM2Q0P670 501 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 TAF10Q12962 218 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.58□□□□□ -0.08
TOM1-211ENST00000449508 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.9 ms