RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 SLC9A9Q8IVB4 645 aa21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 FSIP1Q8NA03 581 aa21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 GOLGA5Q8TBA6 731 aa21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 C8orf48Q96LL4 319 aa21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 EXOC1Q9NV70 894 aa21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP21.45■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 TRIM66O15016 1216 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 HRO43593 1189 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 VNN1O95497 513 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 GJA4P35212 333 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 NOP14P78316 857 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 FOXK2Q01167 660 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PSMD2Q13200 908 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SH3RF2Q8TEC5 729 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 OSCP1Q8WVF1 389 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ELMO3Q96BJ8 720 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SMYD3Q9H7B4 428 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ECT2Q9H8V3 914 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 DLL3Q9NYJ7 618 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 WNT6Q9Y6F9 365 aa21.44■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 HDCP19113 662 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ANXA13P27216 316 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 HOXA6P31267 233 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 CDH8P55286 799 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 DLG4P78352 724 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 LPAL2Q16609 132 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 EML3Q32P44 896 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 LONP2Q86WA8 852 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SPATA32Q96LK8 384 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 B3GNT5Q9BYG0 378 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 SDCBP2Q9H190 292 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PARD6AQ9NPB6 346 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 USP25Q9UHP3 1055 aa21.43■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF840PA6NDX5 716 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 A8MXQ7 604 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 CLDN5O00501 218 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PDXKO00764 312 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PHACTR2O75167 634 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 OLFM2O95897 454 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 EGFP01133 1207 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PRR29P0C7W0 189 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 GALK1P51570 392 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 AP3M2P53677 418 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 KRT85P78386 507 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 BIRC3Q13489 604 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 KCNB1Q14721 858 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 CPA6Q8N4T0 437 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ELOVL4Q9GZR5 314 aa21.42■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa21.42■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 MYL1P05976 194 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PFKLP17858 780 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 RAP1GAPP47736 663 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 IFNAR2P48551 515 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 NDUFA8P51970 172 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 NCOA4Q13772 614 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF699Q32M78 642 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 C1orf220Q5T0J3 134 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 LAIR1Q6GTX8 287 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 PAQR9Q6ZVX9 377 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 TTC16Q8NEE8 873 aa21.41■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 LINC00597Q9H2U6 94 aa21.41■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 MYO16Q9Y6X6 1858 aa21.41■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa21.41■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 RNF40O75150 1001 aa21.4■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 SLC7A9P82251 487 aa21.4■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 ZACNQ401N2 412 aa21.4■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 PRR23BQ6ZRT6 265 aa21.4■■□□□ 1.02
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HLA-B-250ENST00000434333 ATP2A3Q93084 1043 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 RNF38Q9H0F5 515 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 EHD2Q9NZN4 543 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa21.4■■□□□ 1.02
HLA-B-250ENST00000434333 OAS1P00973 400 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-250ENST00000434333 DRD1P21728 446 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-250ENST00000434333 SYKP43405 635 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-250ENST00000434333 PPP3CCP48454 512 aa21.39■■□□□ 1.01
HLA-B-250ENST00000434333 PDE6CP51160 858 aa21.39■■□□□ 1.01
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