RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424519.1

MTM1-204, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 3

Gene MTM1, Length 361 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-204ENST00000424519 SPTBN2O15020 2390 aa16.05■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SPAG17Q6Q759 2223 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 MYH10P35580 1976 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 HELZP42694 1942 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TACC1O75410 805 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 RAP1GAPP47736 663 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 DLG4P78352 724 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TRPC3Q13507 836 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 EML3Q32P44 896 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 KMT5BQ4FZB7 885 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 VSTM1Q6UX27 236 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SYNPOQ8N3V7 929 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 OSCP1Q8WVF1 389 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SPATA17Q96L03 361 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 MAGEF1Q9HAY2 307 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 GMEB2Q9UKD1 530 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 RAB23Q9ULC3 237 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 CACNA1AO00555 2505 aa16.04■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 UBE4BO95155 1302 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 A8MXQ7 604 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 RNF40O75150 1001 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PHACTR2O75167 634 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ABL1P00519 1130 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SLFN14P0C7P3 912 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 IFNAR2P48551 515 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TNNC1P63316 161 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PDGFRLQ15198 375 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 C12orf56Q8IXR9 622 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 CEP57L1Q8IYX8 460 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 FSIP1Q8NA03 581 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PARD3BQ8TEW8 1205 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 P2RY13Q9BPV8 354 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SDCBP2Q9H190 292 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SMYD3Q9H7B4 428 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 DMAC2Q9NW81 257 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 CFAP45Q9UL16 551 aa16.03■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ZNF840PA6NDX5 716 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 VNN1O95497 513 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PFKFB1P16118 471 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ANXA13P27216 316 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 TAF10Q12962 218 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 USP4Q13107 963 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 BIRC3Q13489 604 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 KCNB1Q14721 858 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 ATL3Q6DD88 541 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 LAIR1Q6GTX8 287 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 PAQR9Q6ZVX9 377 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 WDR5BQ86VZ2 330 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 C8orf48Q96LL4 319 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 KCNK16Q96T55 309 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 SMPD4Q9NXE4 827 aa16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP16.02■□□□□ 0.16
MTM1-204ENST00000424519 DNAH14Q0VDD8 3507 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 DCDC2BA2VCK2 349 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 LEFTY2O00292 366 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 AXIN1O15169 862 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 RETP07949 1114 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 FAM163BP0C2L3 166 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 PRR29P0C7W0 189 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 PSMD2Q13200 908 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 ORC1Q13415 861 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 CCDC6Q16204 474 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 SCARA5Q6ZMJ2 495 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 CEP68Q76N32 757 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 CPA6Q8N4T0 437 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 KCTD10Q9H3F6 313 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP16.01■□□□□ 0.156e-6■■■■■ 48.1
MTM1-204ENST00000424519 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 SLC8A2Q9UPR5 921 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 TRIM66O15016 1216 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 GDF9O60383 454 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 STAU1O95793 577 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 DRD1P21728 446 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 CMA1P23946 247 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 HOXA6P31267 233 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 ATICP31939 592 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 CNR2P34972 360 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 SLC6A11P48066 632 aa16■□□□□ 0.15
MTM1-204ENST00000424519 GAB4Q2WGN9 574 aa16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms