RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 RAB39AQ14964 217 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 INAVAQ3KP66 663 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 TAPT1Q6NXT6 567 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 VGLL2Q8N8G2 317 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 POC1BQ8TC44 478 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 RFKQ969G6 155 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 HDAC10Q969S8 669 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 DMRTA2Q96SC8 542 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 IPPQ9Y573 584 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 PAPPAQ13219 1627 aa6.1□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 CHD4Q14839 1912 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 NSD2O96028 1365 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 E9PLN8 166 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 NDUFS2O75306 463 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 LATS1O95835 1130 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 ANXA1P04083 346 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 NPTX2P47972 431 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 TLE1Q04724 770 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 FAM153CQ494X1 144 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 AMOTL1Q8IY63 956 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 VKORC1Q9BQB6 163 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 POLR3GLQ9BT43 218 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 PCGF6Q9BYE7 350 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 NIPSNAP3AQ9UFN0 247 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 ZBTB32Q9Y2Y4 487 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PTPRC-204ENST00000367379 QSER1Q2KHR3 1735 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PALLDQ8WX93 1383 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 DRD4P21917 467 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 LPOP22079 712 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 MTX3Q5HYI7 312 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 JADE3Q92613 823 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TRIB1Q96RU8 372 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 OSBPL9Q96SU4 736 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ALG8Q9BVK2 526 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TMOD3Q9NYL9 352 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SERGEFQ9UGK8 458 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PADI4Q9UM07 663 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 DOT1LQ8TEK3 1739 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 KIF20BQ96Q89 1820 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CEP350Q5VT06 3117 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 A0A0B4J269 797 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TP73O15350 636 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TTLL1O95922 423 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 RHOP08100 348 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 EDNRBP24530 442 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 GRM1Q13255 1194 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TUBB3Q13509 450 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SUMO4Q6EEV6 95 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PIGBQ92521 554 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SEMA4CQ9C0C4 833 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 POLKQ9UBT6 870 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 LY75O60449 1722 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PRR35P0CG20 571 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 C5AR1P21730 350 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PCSK6P29122 969 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 C1QTNF8P60827 252 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 IL10RAQ13651 578 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 C3orf36Q3SXR2 165 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ZNF626Q68DY1 528 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PDSS2Q86YH6 399 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SCAMP4Q969E2 229 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SMOQ99835 787 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SERTAD4Q9NUC0 356 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ETAA1Q9NY74 926 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 BTBD3Q9Y2F9 522 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHB1Q9Y5F3 818 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SHANK3Q9BYB0 1731 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 TARM1B6A8C7 271 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 ERVV-2B6SEH9 535 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 KCNAB3O43448 404 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 NR2F6P10588 404 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 PHKG2P15735 406 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CCT8P50990 548 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SLC16A1P53985 500 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 CLUL1Q15846 466 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 SDE2Q6IQ49 451 aa6.05□□□□□ -1.44
PTPRC-204ENST00000367379 GADL1Q6ZQY3 521 aa6.05□□□□□ -1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.8 ms