RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362776.1

RNU6-1272P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1272, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1272P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SQORQ9Y6N5 450 aa2.35□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CD8B2A6NJW9 211 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CYSRT1A8MQ03 144 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AP4M1O00189 453 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GABRDO14764 452 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZRANB2O95218 330 aaKnown RBP eCLIP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TOMM40O96008 361 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CRYABP02511 175 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRKCBP05771 671 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CSF1RP07333 972 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM90A13PP0C7W8 464 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM90A24PP0C7X0 464 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PSG1P11464 419 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TYRP14679 529 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADORA2AP29274 412 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VIPR2P41587 438 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KCNJ5P48544 419 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MAP2K6P52564 334 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SATB1Q01826 763 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ITKQ08881 620 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MTMR1Q13613 665 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEMA3AQ14563 771 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ODF1Q14990 250 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AWAT1Q58HT5 328 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MTHFD1LQ6UB35 978 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CAND1Q86VP6 1230 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 OSR1Q8TAX0 266 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 FAM167AQ96KS9 214 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MOGAT1Q96PD6 335 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ASIC5Q9NY37 505 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PROCRQ9UNN8 238 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRKAB1Q9Y478 270 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SNX14Q9Y5W7 946 aa2.34□□□□□ -2.03
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KATNA1O75449 491 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 A1BGP04217 495 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HDCP19113 662 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SOX8P57073 446 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PSG6Q00889 435 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MYO1EQ12965 1108 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ERV3-1Q14264 604 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MLC1Q15049 377 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TWIST1Q15672 202 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PTPN21Q16825 1174 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LY6KQ17RY6 165 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LEXMQ3ZCV2 418 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CCDC157Q569K6 752 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 EMC10Q5UCC4 262 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 DLK2Q6UY11 383 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PIP4P1Q86T03 277 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LYZL4Q96KX0 146 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SIGLEC11Q96RL6 698 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PRR25Q96S07 402 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 VPS33BQ9H267 617 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 POT1Q9NUX5 634 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PNPOQ9NVS9 261 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PI4KBQ9UBF8 816 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 HEY2Q9UBP5 337 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa2.33□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 B4DGG1 531 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 BTBD19C9JJ37 291 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 H3BUI4 141 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CLSTN1O94985 981 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PDCP20941 246 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 LRPAP1P30533 357 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 THBS4P35443 961 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 GUCY2FP51841 1108 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ID2Q02363 134 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 KRT17Q04695 432 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 PLS1Q14651 629 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SEC23BQ15437 767 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 AMOTQ4VCS5 1084 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 TMTC4Q5T4D3 741 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 COLCA1Q6ZS62 124 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 CATIPQ7Z7H3 387 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF280BQ86YH2 543 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SFTPA1Q8IWL2 248 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 IZUMO1Q8IYV9 350 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ABRAQ8N0Z2 381 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 SIRT6Q8N6T7 355 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 RBMXL3Q8N7X1 1067 aaKnown RBP2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ZNF398Q8TD17 642 aa2.32□□□□□ -2.04
RNU6-1272P-201ENST00000362776 ADAMTS18Q8TE60 1221 aa2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms