RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356825.8

SMAD2-202, Transcript of SMAD family member 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SMAD2, Length 10,445 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD2-202ENST00000356825 GINS4Q9BRT9 223 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 PTGER2P43116 358 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RALGDSQ12967 914 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SPRTNQ9H040 489 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 A0A0G2JLW4 131 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 A0A087X0T9 212 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SERPINB3P29508 390 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SPATA21Q7Z572 469 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ZNF677Q86XU0 584 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 STAG2Q8N3U4 1231 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 EPS8L2Q9H6S3 715 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 POLD4Q9HCU8 107 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 PDZK1P1A8MUH7 402 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 STX7O15400 261 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 GPR1P46091 355 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 POLR1DQ9Y2S0 133 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CDHR2Q9BYE9 1310 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CDH16O75309 829 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RPN2P04844 631 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 UQCRBP14927 111 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 AVPR1AP37288 418 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 TAF6P49848 677 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RPS6P62753 249 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SH3GL1Q99961 368 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 PMPCBO75439 489 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 IFNA14P01570 189 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 WEE1P30291 646 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 STARD3Q14849 445 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 C19orf18Q8NEA5 215 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 GRID1Q9ULK0 1009 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ADGRB3O60242 1522 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 FLT3P36888 993 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 YIPF3Q9GZM5 350 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 WDR41Q9HAD4 459 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SMAPO00193 183 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CRTAMO95727 393 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 GARTP22102 1010 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CASP10Q92851 521 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ALKQ9UM73 1620 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CASP1P29466 404 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CYP24A1Q07973 514 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 AMHR2Q16671 573 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 TERB1Q8NA31 727 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RAB23Q9ULC3 237 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 TDP2O95551 362 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 HSPA13P48723 471 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 E2F4Q16254 413 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 MYO1HQ8N1T3 1032 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CHST13Q8NET6 341 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 AMACRQ9UHK6 382 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 COQ6Q9Y2Z9 468 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ZBTB39O15060 712 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 HUNKP57058 714 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 GEMIN4P57678 1058 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 DENND6AQ8IWF6 608 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 NINQ8N4C6 2090 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ITGAXP20702 1163 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 LONP2Q86WA8 852 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SEPT1Q8WYJ6 367 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 ITIH2P19823 946 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CHRNA5P30532 468 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 COX10Q12887 443 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 C12orf60Q5U649 245 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SH3GL2Q99962 352 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 MYLK2Q9H1R3 596 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 NCF1BA6NI72 391 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 NCF1CA8MVU1 366 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 NCF1P14598 390 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 SERPINB8P50452 374 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CYP39A1Q9NYL5 469 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 MTA1Q13330 715 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 MTSS1LQ765P7 747 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 IQGAP1P46940 1657 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 TRIP11Q15643 1979 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 DLGAP3O95886 979 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CDK20Q8IZL9 346 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 RGS18Q9NS28 235 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 GGA3Q9NZ52 723 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 AGTP01019 485 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD2-202ENST00000356825 CLTBP09497 229 aa14.86□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.4 ms