RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.8■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 HIC1Q14526 733 aa22.79■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 PKDCCQ504Y2 493 aa22.79■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 C9orf57Q5W0N0 161 aa22.79■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 HESX1Q9UBX0 185 aa22.79■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 SNX17Q15036 470 aa22.79■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC38Q502W7 563 aa22.79■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 TTC25Q96NG3 672 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 PEBP4Q96S96 227 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 SLC4A5Q9BY07 1137 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 FAM49BQ9NUQ9 324 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 ANKRD65E5RJM6 399 aa22.78■■□□□ 1.24
SPHK1-201ENST00000323374 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP22.78■■□□□ 1.243e-6■□□□□ 11.2
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SPHK1-201ENST00000323374 CD4P01730 458 aa22.78■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa22.78■■□□□ 1.24
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SPHK1-201ENST00000323374 CCL14Q16627 93 aa22.76■■□□□ 1.23
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SPHK1-201ENST00000323374 Q9Y3F1 56 aa22.76■■□□□ 1.23
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SPHK1-201ENST00000323374 CDO1Q16878 200 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC14Q49A88 953 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 CENPUQ71F23 418 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 STK32AQ8WU08 396 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF560Q96MR9 790 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 RNF19AQ9NV58 838 aa22.76■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 MCF2LO15068 1137 aa22.75■■□□□ 1.23
SPHK1-201ENST00000323374 DESP17661 470 aa22.75■■□□□ 1.23
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