RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298454.3

VSTM4-201, Transcript of V-set and transmembrane domain containing 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene VSTM4, Length 2,170 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM4-201ENST00000298454 VEGFBP49765 207 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CDR1P51861 262 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 BST2Q10589 180 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 C15orf59Q2T9L4 293 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RAB6CQ53S08 254 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TFDP3Q5H9I0 405 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 LHX8Q68G74 356 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 C3orf58Q8NDZ4 430 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC114Q96M63 670 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ADAM2Q99965 735 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RAB6CQ9H0N0 254 aa23.92■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RNF8O76064 485 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TJP3O95049 919 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 KRT7P08729 469 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TKTP29401 623 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 HSD17B3P37058 310 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 COPS2P61201 443 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 FAM26DQ5JW98 314 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TMC3Q7Z5M5 1100 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 STK32AQ8WU08 396 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 LRRC45Q96CN5 670 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TNIP3Q96KP6 325 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PAAF1Q9BRP4 392 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 HOMER3Q9NSC5 361 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ASNSD1Q9NWL6 643 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CASTOR2A6NHX0 329 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF623O75123 536 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 MAP2K2P36507 400 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 BCAT1P54687 386 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SLC6A3Q01959 620 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ATL2Q8NHH9 583 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SENP8Q96LD8 212 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CNPY3Q9BT09 278 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TRAIPQ9BWF2 469 aa23.91■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 A0A0U1RQF3 1178 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 MOXD2PA6NHM9 499 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PTPN7P35236 360 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 HTRA3P83110 453 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 ACAP1Q15027 740 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 CFAP57Q96MR6 1250 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RUFY1Q96T51 708 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 SH3GL2Q99962 352 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 USP18Q9UMW8 372 aa23.9■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 POMCP01189 267 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RAB27AP51159 221 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TERF2Q15554 542 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
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VSTM4-201ENST00000298454 CLEC4CQ8WTT0 213 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 PEBP4Q96S96 227 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 RSAD1Q9HA92 442 aa23.89■■□□□ 1.42
VSTM4-201ENST00000298454 GABRDO14764 452 aa23.89■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 CD48P09326 243 aa23.89■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CKBP12277 381 aa23.89■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CCDC14Q49A88 953 aa23.89■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 KIAA0319Q5VV43 1072 aa23.89■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GRK7Q8WTQ7 553 aa23.89■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CLDN5O00501 218 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 KRT14P02533 472 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 LCP1P13796 627 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 KDELR1P24390 212 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 UBLCP1Q8WVY7 318 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 PLAAQ9Y263 795 aa23.88■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 A0A1W2PQY0 241 aa23.88■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 PCK1P35558 622 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ATP11AP98196 1134 aa23.88■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
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VSTM4-201ENST00000298454 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 NEU2Q9Y3R4 380 aa23.88■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 LIASO43766 372 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GAS8O95995 478 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 GBP1P32455 592 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 SNX16P57768 344 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 UPP1Q16831 310 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 DSTYKQ6XUX3 929 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 CYP4V2Q6ZWL3 525 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 ART4Q93070 314 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 TXLNGYQ9BZA5 131 aa23.87■■□□□ 1.41
VSTM4-201ENST00000298454 PPFIA2O75334 1257 aa23.86■■□□□ 1.41
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