RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028398.13

Ube2e3-201, Transcript of Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ube2e3, Length 2,249 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cd180Q62192 661 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Sh3gl3Q62421 347 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vil1Q62468 827 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atg9bQ6EBV9 922 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cacna2d2Q6PHS9 1154 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rbm12b1Q80YR9 836 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PimregQ8BFY7 231 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spata21Q8BHW6 681 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MutyhQ99P21 515 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Decr1Q9CQ62 335 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Crlf3Q9Z2L7 442 aa22.83■■□□□ 1.25
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm3424L7N298 263 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm8246M0QWX9 263 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Magea6O89010 325 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ndufs6P52503 116 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mark3Q03141 753 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Luc7l3Q5SUF2 432 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Qsox1Q8BND5 748 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mbd1Q9Z2E2 636 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Brca1P48754 1812 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ms4a14A0A087WSD2 1232 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tada2bD3Z4Z0 420 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Apol11aE9PZG0 334 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 PigrO70570 771 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Aimp1P31230 310 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gabrb2P63137 512 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Spata24Q6P926 205 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gpatch2lQ6PE65 482 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsdl1Q8BTX9 330 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SowahcQ8C0J6 512 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Angel1Q8VCU0 667 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ttc8Q8VD72 515 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 TgdsQ8VDR7 355 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Caln1Q9JJG7 219 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Plod3Q9R0E1 741 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MycsQ9Z304 431 aa22.82■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptpn11P35235 597 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 SftpbP50405 377 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Npas2P97460 816 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Epas1P97481 874 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Yipf3Q3UDR8 347 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Psd2Q6P1I6 770 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Supt20hQ7TT00 530 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ankzf1Q80UU1 748 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Upb1Q8VC97 393 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgd4Q91ZT5 766 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trps1Q925H1 1281 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Slc25a19Q9DAM5 318 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fut2Q9JL27 347 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Vmn2r39L7N2E5 861 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 StrnO55106 780 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hoxb8P09632 243 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grb7Q03160 535 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fcrl5Q68SN8 596 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Rsl1d1Q8BVY0 452 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam151aQ8QZW3 608 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp6v1g2Q9WTT4 118 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NinQ61043 2035 aa22.81■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fgl2P12804 432 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NyxP83503 476 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Garnl3Q3V0G7 1038 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dcaf15Q6PFH3 600 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc68Q8BVC4 333 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Trub1Q8C0D0 338 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Pomgnt1Q91X88 660 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ptdss1Q99LH2 473 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arl8bQ9CQW2 186 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Bbs5Q9CZQ9 341 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccdc22Q9JIG7 627 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 B4galt5Q9JMK0 388 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Copg2Q9QXK3 871 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Uts2Q9QZQ3 123 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Cdr2lA2A6T1 465 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp8b4A2ANX3 1194 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Farp1F8VPU2 1048 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Dynlt1P51807 113 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Atp11aP98197 1187 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 InhbaQ04998 424 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gm29609Q3UU56 907 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Capn3Q64691 821 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Gtf3c2Q8BL74 907 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 NemfQ8CCP0 1064 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Arfip2Q8K221 341 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Q9CPS8 106 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Smyd3Q9CWR2 428 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 MceeQ9D1I5 178 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tmem68Q9D850 329 aa22.8■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Fam47eD3YWC7 402 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 DldO08749 509 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ccng1P51945 294 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Ythdf1P59326 559 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Tars2Q3UQ84 723 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Grm6Q5NCH9 871 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Samhd1Q60710 627 aa22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Hif1aQ61221 836 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
Ube2e3-201ENSMUST00000028398 Btbd10Q80X66 475 aa22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 20.8 ms