RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000001226.9

Sh3bp1-201, Transcript of SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

TSL 5 BASIC

Gene Sh3bp1, Length 2,510 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stx18Q8VDS8 334 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pomgnt1Q91X88 660 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 TfQ921I1 697 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Dpp3Q99KK7 738 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Smyd3Q9CWR2 428 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MceeQ9D1I5 178 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr3cQ9D483 533 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Piwil1Q9JMB7 862 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 MycsQ9Z304 431 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zc3h7aE9PWW6 970 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Zfp94E9Q6Y4 486 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 F6Y6L6 278 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3424L7N298 263 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm8246M0QWX9 263 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vti1aO89116 217 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 HpdP49429 393 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CiitaP79621 1155 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gsdmc4Q3TR54 480 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arhgef18Q6P9R4 1021 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1505Q7TQQ2 316 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccdc40Q8BI79 1192 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ints6lQ8BND4 861 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rev1Q920Q2 1249 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas1r3Q925D8 858 aa17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sgf29Q9DA08 293 aaKnown RBP17.82■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 B020011L13RikA0A087WQI7 412 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr1305A2AVW3 312 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3371F7CQW8 167 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vmn2r39L7N2E5 861 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 DldO08749 509 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 IapP03975 557 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cetn1P41209 172 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SftpdP50404 374 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mark3Q03141 753 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Glt6d1Q2NKH9 311 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mphosph8Q3TYA6 858 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Spag6Q3V0U9 509 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rgl2Q61193 778 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 FcgrtQ61559 365 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Elac2Q80Y81 831 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mrpl4Q9DCU6 294 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmod2Q9JKK7 351 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fam171a2A2A699 822 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Per2O54943 1257 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mxi1P50540 228 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Serping1P97290 504 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Cd180Q62192 661 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Q6GQV0 436 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf598Q80YR4 908 aaKnown RBP17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kcnd2Q9Z0V2 630 aa17.81■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 1700064H15RikD3Z4D4 81 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prom1O54990 867 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 GmpsQ3THK7 693 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm3414Q3TNU4 584 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ddr2Q62371 854 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Sh3gl3Q62421 347 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tas2r109Q7M707 316 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsdl1Q8BTX9 330 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tasp1Q8R1G1 420 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mxra7Q9CZH7 178 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ubxn11Q9D572 484 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Vwa7Q9JHA8 891 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tmod4Q9JLH8 345 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Gm29554A0A087WNW4 188 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 0610012G03RikA0A0J9YTR2 95 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fignl2J3QK54 644 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Efna5O08543 228 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Nek2O35942 443 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Pgk1P09411 417 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 YwhagP61982 247 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 RenbpP82343 430 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Znf746Q3U133 652 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Prkaa1Q5EG47 559 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Grik1Q60934 836 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Eif2dQ61211 570 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 ErfeQ6PGN1 340 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Acot5Q6Q2Z6 421 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 PrcpQ7TMR0 491 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 SowahcQ8C0J6 512 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Arfip2Q8K221 341 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fcho1Q8K285 873 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr395Q8VGR3 312 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Olfr385Q8VGT1 312 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Xpo5Q924C1 1204 aaKnown RBP17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Mcrs1Q99L90 462 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Fut2Q9JL27 347 aa17.8■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 NinQ61043 2035 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Hsd17b14E9Q3D4 273 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 CidebO70303 219 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 YwhazP63101 245 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Atp11aP98197 1187 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rab34Q64008 259 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Tfdp2Q64163 446 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Btbd10Q80X66 475 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Rhpn2Q8BWR8 686 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Kctd15Q8K0E1 283 aa17.79■□□□□ 0.44
Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 Ier5lQ99J55 406 aa17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 17.9 ms