RNA–Protein interactions for RNA: YOR231W

MKK1, Transcript of MAPKK involved in the protein kinase C signaling pathway, yeast

Gene MKK1, Length 1,527 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MKK1	YOR231W	DNF1	P32660	1571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	TDA2	P40045	126 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	RPL40A	P0CH08	128 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	RPL40B	P0CH09	128 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	HUR1	P45820	110 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	YNR064C	P53750	290 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	MRPS8	Q03799	155 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	YLR296W	Q05898	108 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	ODC2	Q99297	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
MKK1	YOR231W	YBR292C	P38357	123 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	COX12	Q01519	83 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	PAU16	P35994	123 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YHL042W	P38729	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	MIC27	P50945	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	GRX5	Q02784	150 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	MAK31	P23059	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	NHP2	P32495	156 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
MKK1	YOR231W	RIM9	Q04734	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	FYV12	Q08559	129 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	MYO1	P08964	1928 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ATP20	Q12233	115 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YPL038W-A	Q3E7B4	63 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	SCS22	Q6Q595	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	RPB9	P27999	122 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YKR045C	P36138	183 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	UMP1	P38293	148 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YHP1	Q04116	353 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ECM29	P38737	1868 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YBT1	P32386	1661 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	TIM9	O74700	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	NCA3	P46955	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	LIP1	Q03579	150 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ATG41	Q12048	136 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YPL247C	Q12523	523 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YOR093C	Q12275	1648 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YCR043C	P25361	127 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YKL044W	P36092	106 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	YEL073C	P39974	107 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	ATP19	P81451	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	TVP15	Q03860	143 aa		4.91	□□□□□ -1.62
MKK1	YOR231W	MRPS9	P38120	278 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	PAU5	P43575	122 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	BNS1	P50084	137 aa		4.9	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RPL21B	Q12672	160 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YHR213W	P0CI67	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RRT13	P40042	185 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YDR381C-A	Q3E6R5	114 aa		4.89	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	DUR1,2	P32528	1835 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YEL045C	P32616	141 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YHL005C	P38752	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RSM18	P40033	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	CRH1	P53301	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YKL023C-A	Q2V2P3	75 aa		4.88	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RRT1	P38192	103 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YNL217W	P40152	326 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YDR274C	P87283	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	DNF2	Q12675	1612 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	HSP10	P38910	106 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	TVP23	P38962	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YOR105W	Q08504	108 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RPL21A	Q02753	160 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YMR295C	Q03559	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	AYT1	Q12226	474 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	FYV5	P25585	152 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	QCR10	P37299	77 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	CTR2	P38865	189 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YGL118C	P53132	145 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YML122C	Q03207	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	ICY1	Q04329	127 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	HPA2	Q06592	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	FZF1	P32805	299 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	IGO1	P53897	168 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	MET31	Q03081	177 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	YMR244W	Q04018	355 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	SRL1	Q08673	210 aa		4.84	□□□□□ -1.63
MKK1	YOR231W	RIM15	P43565	1770 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	YER187W	P40102	141 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	API2	Q04413	109 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	YOR381W-A	Q3E804	55 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.83	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	MDM35	O60200	86 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	HOT13	P36078	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
MKK1	YOR231W	YIL054W	P40524	105 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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