RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	VMA11	P32842	164 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YKR032W	P36127	104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	LCB3	P47013	409 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PAU23	Q07987	124 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YOL160W	Q08321	113 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PAU17	Q12370	124 aa		3.81	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	HAP3	P13434	144 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	3.8	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	UBC7	Q02159	165 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YLR281C	Q05863	155 aa		3.8	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	SIM1	P40472	476 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		3.79	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	TEL1	P38110	2787 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	MST27	P53176	234 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	YGR219W	P53307	113 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	CWC27	Q02770	301 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	VPS71	Q03433	280 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	GPI19	Q04082	140 aa		3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
TRS33	YOR115C	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YHL044W	P38727	235 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YHR140W	P38842	239 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MST28	P39552	234 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	POR2	P40478	281 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	UPS3	Q04006	179 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	TVP18	Q04767	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YMR317W	Q04893	1140 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YPR013C	Q12145	317 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	TIM22	Q12328	207 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YOL085C	Q99345	113 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	TRA1	P38811	3744 aa		3.77	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YCR043C	P25361	127 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	SNF11	P38956	169 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	COX16	P47081	118 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	BET5	Q03630	159 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	ATG39	Q06159	398 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	GEP3	Q08622	556 aa		3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YLR050C	Q12155	161 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YCR023C	P25351	611 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MIC12	P38341	106 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YER076C	P40049	302 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	SPI1	P40092	148 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MIC26	P50087	233 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	CAB4	P53332	305 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	DIA1	P54005	336 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YDR042C	Q03205	200 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	DFM1	Q12743	341 aa	Known RBP	3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		3.75	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	INO2	P26798	304 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	APS1	P35181	156 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	RPR2	P40571	144 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	TOS8	P53147	276 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YDR366C	P87287	132 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	DGA1	Q08650	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	SRL1	Q08673	210 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	PRM7	Q12459	698 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YOR011W-A	Q3E807	68 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	HTL1	Q9URQ5	78 aa		3.74	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	TOR1	P35169	2470 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	SAL1	D6W196	494 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MBF1	O14467	151 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	AGA1	P32323	725 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YDL186W	P48568	277 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	CAX4	P53223	239 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MGR2	Q02889	113 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YMR103C	Q04436	120 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		3.73	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	PFY1	P07274	126 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	HMRA2	P0CY13	119 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	YHR022C	P38763	256 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	RPF1	P38805	295 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	VPS55	P47111	140 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	SPO24	Q3E752	67 aa		3.72	□□□□□ -1.81
TRS33	YOR115C	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	MRP49	P32388	137 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YKL044W	P36092	106 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YER135C	P40082	130 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YPL073C	P40323	161 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	ABM1	P47146	123 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YIP3	P53633	176 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	HOR7	Q05827	59 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	COA3	Q3E7B2	85 aa		3.71	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YDL022C-A	P0C5L6	82 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YEL067C	P39978	195 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YNL198C	P40166	100 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YNL194C	P40169	301 aa		3.7	□□□□□ -1.82
TRS33	YOR115C	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.7	□□□□□ -1.82

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