RNA–Protein interactions for RNA: YML007W

YAP1, Transcript of Basic leucine zipper (bZIP) transcription factor, yeast

Gene YAP1, Length 1,953 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YAP1	YML007W	CSM4	Q08955	156 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YLR118C	Q12354	227 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	AGA1	P32323	725 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	SRP14	P38985	146 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	PAU7	P39545	55 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	ERG28	P40030	148 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	PAU5	P43575	122 aa		3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.82	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	IRC22	P40006	225 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	HUA1	P40325	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	PGD1	P40356	397 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	AIM34	Q03673	198 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	POM33	Q12164	279 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.81	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YCR001W	P25347	104 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YHR140W	P38842	239 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	PAU15	P40585	124 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YPS5	P53057	165 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	ZEO1	Q08245	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	RPL16B	P26785	198 aa	Known RBP	3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	RPB11	P38902	120 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	UIP3	P39547	235 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YOL085C	Q99345	113 aa		3.8	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	CNB1	P25296	175 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	FZF1	P32805	299 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	MRPL28	P36527	147 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	RRT13	P40042	185 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		3.79	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	YGL010W	P25338	174 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	MIX23	P38162	196 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	TEM1	P38987	245 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	SPC1	P46965	94 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	GPI19	Q04082	140 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	3.78	□□□□□ -1.8	not detected
YAP1	YML007W	YBR090C	P38253	122 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	HHO1	P53551	258 aa		3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	TPT1	Q12272	230 aa	Known RBP	3.78	□□□□□ -1.8
YAP1	YML007W	VMA21	P41806	77 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	ERI1	P62651	68 aa	Known RBP	3.77	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	TVP18	Q04767	167 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	CRC1	Q12289	327 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YNR034W-A	Q3E841	98 aa		3.77	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YNL217W	P40152	326 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	CUP2	P15315	225 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	ZRT1	P32804	376 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPR2	P40571	144 aa		3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPS22B	Q3E7Y3	130 aa	Known RBP	3.76	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YPR010C-A	A5Z2X5	72 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YLR415C	O13578	112 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PAU19	P0CE85	124 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PAU21	P0CE86	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PAU22	P0CE87	164 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PAU3	P25610	124 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	KRE9	P39005	276 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	DAN1	P47178	298 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PMP3	P87284	55 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YLR042C	Q07990	161 aa		3.75	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	SDH8	P38345	138 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	DXO1	Q06349	442 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPP2A	P05319	106 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPL32	P38061	130 aa	Known RBP	3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YGR017W	P53210	297 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	DGA1	Q08650	418 aa		3.74	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YCR023C	P25351	611 aa		3.73	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.73	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	MRP49	P32388	137 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	GTT1	P40582	234 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YFR057W	P43625	151 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	PAM17	P36147	197 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		3.72	□□□□□ -1.81
YAP1	YML007W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	UBC5	P15732	148 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	SDS23	P53172	527 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	ATP23	P53722	227 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	RTC6	O14464	93 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	YKR070W	P36151	352 aa	Known RBP	3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	DCV1	P43595	202 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	YJL028W	P47062	111 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		3.71	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	YBR013C	P38215	129 aa		3.7	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	YNL200C	P40165	246 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	3.7	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	PFY1	P07274	126 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	YGL118C	P53132	145 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	DPP1	Q05521	289 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	SAL1	D6W196	494 aa		3.69	□□□□□ -1.82
YAP1	YML007W	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82

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