RNA–Protein interactions for RNA: YKR067W

GPT2, Transcript of Glycerol-3-phosphate/dihydroxyacetone phosphate sn-1 acyltransferase, yeast

Gene GPT2, Length 2,232 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
GPT2	YKR067W	MTC6	P38849	526 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	SKI6	P46948	246 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	SMP1	P38128	452 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	EMC5	P40540	141 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	GPI19	Q04082	140 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YOL118C	Q08259	102 aa		4.7	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	ECO1	P43605	281 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YGL193C	P53097	103 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	MIX23	P38162	196 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	4.69	□□□□□ -1.66	not detected
GPT2	YKR067W	KNH1	P50112	268 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	SDS23	P53172	527 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YOR192C-C	Q3E736	78 aa		4.69	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	ERG2	P32352	222 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YFL015C	P43578	164 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	CYT2	Q00873	224 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	COA2	Q3E823	68 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YFR032C-B	Q8TGU2	87 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	UTR5	P32630	166 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	RPB7	P34087	171 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YCR041W	P37265	110 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	SWD3	P38123	315 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	ADD37	Q03233	198 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YPL264C	Q08980	353 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	ATO3	Q12359	275 aa		4.68	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	RPS8A	P0CX39	200 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	RPS8B	P0CX40	200 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YCR025C	P25352	136 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YCR050C	P25630	102 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	FLO5	P38894	1075 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	DSK2	P48510	373 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	CAX4	P53223	239 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	HUG1	Q6Q5K6	68 aa		4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	UTP20	P35194	2493 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YCR085W	P25650	117 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YLR112W	Q12130	139 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YOR015W	Q12169	119 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	JID1	Q12350	301 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	YLR365W	Q7LIF2	110 aa		4.66	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	UBC4	P15731	148 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	MAK32	P23060	363 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	PAU23	Q07987	124 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	PAU17	Q12370	124 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	COX19	Q3E731	98 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	TDA8	Q6B2U8	126 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	MIC10	Q96VH5	97 aa		4.65	□□□□□ -1.66
GPT2	YKR067W	RPS25B	P0C0T4	108 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	DDR48	P18899	430 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	FYV4	P38783	130 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	NSA2	P40078	261 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	FLX1	P40464	311 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RPS25A	Q3E792	108 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YPR108W-A	Q3E7B3	70 aa		4.65	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		4.64	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	POR1	P04840	283 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	IMP1	P28627	190 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	MID2	P36027	376 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	ATX1	P38636	73 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YFL019C	P43576	117 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	PIN3	Q06449	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	USV1	Q12132	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YAL064W	P39711	94 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YER084W	P40057	128 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	VMA21	P41806	77 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YDR114C	Q04597	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RRT15	Q3E811	62 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	ENV10	Q99382	181 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YHL018W	P38744	120 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YNL198C	P40166	100 aa		4.62	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RPL23A	P0CX41	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	PIR5	P46999	287 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	BNS1	P50084	137 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	LPP1	Q04396	274 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	DAD1	Q12248	94 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YER135C	P40082	130 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	FSH2	Q05015	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	GPI18	P38211	433 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YFR035C	P43608	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	RIM9	Q04734	239 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YML100W-A	Q8TGT0	57 aa		4.6	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YOL014W	Q08110	124 aa		4.59	□□□□□ -1.67
GPT2	YKR067W	YMR254C	Q04838	102 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	IRC25	Q07951	179 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	YPL278C	Q08990	100 aa		4.58	□□□□□ -1.68
GPT2	YKR067W	ATG40	Q99325	256 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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