RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	SPS2	P08459	502 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YCR023C	P25351	611 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SLM6	P38343	150 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	HIT1	P46973	164 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	GIM3	P53900	129 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	FIT2	Q08906	153 aa		0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ACP1	P32463	125 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YHR173C	P38864	112 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SDS23	P53172	527 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	AIM34	Q03673	198 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	DAD1	Q12248	94 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRS1	P07266	363 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	HYP2	P23301	157 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YKE4	P40544	346 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TAD2	P47058	250 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	DAN1	P47178	298 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRX11	Q03079	207 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ATC1	Q04005	294 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YMR082C	Q04276	118 aa		0.7	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	UBC4	P15731	148 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	POF1	P25576	258 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SRP21	P32342	167 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	AIM29	P36154	155 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YEA6	P39953	335 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MOG1	P47123	218 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	UPS3	Q04006	179 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PAM17	P36147	197 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.69	□□□□□ -2.3	not detected
TTI1	YKL033W	EMC5	P40540	141 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YFR045W	P43617	309 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YDL241W	Q07738	123 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	STF1	P01098	86 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YLR156W	P0CE96	114 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YLR159W	P0CE97	114 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YLR161W	P0CE98	114 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPL16A	P26784	199 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MSK1	P32048	576 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YBR219C	P38317	127 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SUR2	P38992	349 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YAR029W	P39549	74 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	AIM19	P40502	157 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CWP2	P43497	92 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ILM1	P47155	203 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	NAT3	Q06504	195 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TIM22	Q12328	207 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YCR024C-B	Q3E7Z8	88 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YMR122W-A	Q3E842	84 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		0.69	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SEC59	P20048	519 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	AME1	P38313	324 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	DCV1	P43595	202 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	TVP18	Q04767	167 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CSM4	Q08955	156 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	AHT1	P29589	182 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SPT14	P32363	452 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPC10	P40422	70 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	JAC1	P53193	184 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YOR268C	Q08734	132 aa		0.68	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	THG1	P53215	237 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PMP3	P87284	55 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	DCN1	Q12395	269 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	QRI5	P32344	111 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YKR032W	P36127	104 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PET8	P38921	284 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	CIN5	P40917	295 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YJR146W	P47174	117 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRPL50	P53724	139 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	GTO3	Q04806	366 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ACB1	P31787	87 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	RPB11	P38902	120 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YGL193C	P53097	103 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	WIP1	Q2V2P8	89 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PCC1	Q3E833	88 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	Q0032	Q9ZZX7	96 aa		0.67	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	PRE1	P22141	198 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	DAD2	P36162	133 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YBR242W	P38331	238 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	YEA4	P40004	342 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	ATP19	P81451	68 aa		0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	MRPL31	P14063	131 aa	Predicted RBP	0.66	□□□□□ -2.3
TTI1	YKL033W	QCR9	P22289	66 aa		0.66	□□□□□ -2.3

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