RNA–Protein interactions for RNA: YJL104W

PAM16, Transcript of Subunit of the import motor (PAM complex), yeast

Gene PAM16, Length 450 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PAM16	YJL104W	NAT3	Q06504	195 aa		0.51	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	AIM45	Q12480	344 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	TFB5	Q3E7C1	72 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	PET20	Q99373	253 aa		0.51	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	MRS1	P07266	363 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	UBC5	P15732	148 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YCR023C	P25351	611 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	HMX1	P32339	317 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SPT14	P32363	452 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	MRP49	P32388	137 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DAD2	P36162	133 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YHL005C	P38752	130 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	EGD2	P38879	174 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	COX14	P39103	70 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YEA4	P40004	342 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPC10	P40422	70 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SMD1	Q02260	146 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	VPS28	Q02767	242 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	ATC1	Q04005	294 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	TVP18	Q04767	167 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	KEI1	Q06346	221 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	TIM22	Q12328	207 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YBR200W-A	Q3E755	54 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YLR342W-A	Q3E810	57 aa		0.5	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	QCR2	P07257	368 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YBL039W-B	P0C268	59 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	HAP3	P13434	144 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	CDC10	P25342	322 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	APS1	P35181	156 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YKL162C	P36052	402 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	AIM29	P36154	155 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	AME1	P38313	324 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SPI1	P40092	148 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SWM2	P40342	146 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	PAM16	P42949	149 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	BNA6	P43619	295 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	AIM25	P47140	327 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DAD4	P69851	72 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RGM1	Q00453	211 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YDR042C	Q03205	200 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	PLP1	Q04004	230 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	CTR3	Q06686	241 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	CSM4	Q08955	156 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YLR118C	Q12354	227 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		0.49	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	ADH3	P07246	375 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	GCN3	P14741	305 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	QRI5	P32344	111 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YKR041W	P36134	250 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YHR173C	P38864	112 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	POG1	P40473	351 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YGL193C	P53097	103 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YGL088W	P53151	121 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YGR026W	P53217	278 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	HCH1	P53834	153 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DID2	P69771	204 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	DDR2	P89113	61 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YDR210W	Q03482	75 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	AVO2	Q04749	426 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YOR105W	Q08504	108 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	PEX27	Q08580	376 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	FSF1	Q12029	327 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YLR146W-A	Q2V2P1	62 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YNL042W-B	Q3E7Z2	85 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YGR121W-A	Q3E816	71 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		0.48	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	HIS3	P06633	220 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YLR157W-D	P0CE99	70 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPL12A	P0CX53	165 aa	Known RBP	0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	RPL12B	P0CX54	165 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	KRE1	P17260	313 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	QCR9	P22289	66 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SCM4	P32564	187 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	TOA2	P32774	122 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	SLM6	P38343	150 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YHR140W	P38842	239 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YMR141C	P40211	102 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YGR149W	P48236	432 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YNR066C	P53752	436 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	MAK3	Q03503	176 aa		0.47	□□□□□ -2.33
PAM16	YJL104W	YMR007W	Q03675	126 aa		0.47	□□□□□ -2.33

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