RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A EFM5P53200 248 aaKnown RBP0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YGR017WP53210 297 aa0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A ELC1Q03071 99 aa0.03□□□□□ -2.4
RPC10YHR143W-A YAP3P38749 330 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A ICS3P47034 131 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A LCL1Q02786 101 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A HPA2Q06592 156 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YDR010CQ12426 110 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A ENV10Q99382 181 aa0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YEA6P39953 335 aa0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A MPC1P53157 130 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A TVP18Q04767 167 aa0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A OCA6Q12454 224 aa0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YGR240C-AQ3E786 66 aa0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A RPL22AP05749 121 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A CUP1-1P0CX80 61 aa0□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A CUP1-2P0CX81 61 aa0□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A PHS1P40857 217 aa0□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A SEC7P11075 2009 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A SEC59P20048 519 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A TRS20P38334 175 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A ERV14P53173 138 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YGL041C-BQ3E750 60 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YOL164W-AQ3E7A5 60 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YNL277W-AQ3E7Z0 62 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A TY4B-HP0C2J7 1802 aa-0.01□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A TRM732Q03496 1420 aa-0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A URB1P34241 1764 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YRF1-6P53819 1859 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A GIM4P40005 111 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YIL014C-AQ02598 104 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A CSN9Q03981 162 aa-0.03□□□□□ -2.41
RPC10YHR143W-A YJL197C-AP0C5P0 93 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A HYM1P32464 399 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YHR173CP38864 112 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A CYB5P40312 120 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A VPS55P47111 140 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A Q0144Q9ZZW2 109 aa-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A RPO21P04050 1733 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A POL2P21951 2222 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YKL044WP36092 106 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A RPS20P38701 121 aaKnown RBP-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A GPI19Q04082 140 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YLR285C-AQ3E771 56 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YBR072C-AQ3E794 53 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YPK9Q12697 1472 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A ECM5Q03214 1411 aa-0.05□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A QCR6P00127 147 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A GAT4P40569 121 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SFT1P43682 97 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SLO1Q3E784 85 aa-0.06□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A MRPS12P53732 153 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YDR278CQ05612 105 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A CNL1Q06333 122 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A IRC20Q06554 1556 aa-0.07□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A COX23P38824 151 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A CYC2P38909 366 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SNF11P38956 169 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A PAU12P53343 120 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SAE3P89114 91 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YOR376W-AQ3E805 51 aa-0.08□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A MON2P48563 1636 aaPredicted RBP-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YPL261CQ08976 102 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A YLR363W-AQ3E747 85 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A PCC1Q3E833 88 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A OST5Q92316 86 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SIN3P22579 1536 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A DNA2P38859 1522 aa-0.09□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A THO2P53552 1597 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A SSK2P53599 1579 aa-0.1□□□□□ -2.42
RPC10YHR143W-A DOP1Q03921 1698 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A ACP1P32463 125 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A RPA12P32529 125 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A POP7P38291 140 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YHR130CP38834 111 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A GCV3P39726 170 aaPredicted RBP-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YNL190WP53872 204 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TIM8P57744 87 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A FRQ1Q06389 190 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YLR361C-AQ3E795 98 aa-0.1□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YRF1-2P40105 1681 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A NUP192P47054 1683 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A XRN1P22147 1528 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY1B-DR4Q07793 1604 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YOR093CQ12275 1648 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A HMRA2P0CY13 119 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A YGL204CP53089 101 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A SPC24Q04477 213 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY1B-NL2Q99337 1749 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A MYO2P19524 1574 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A KOG1P38873 1557 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY2B-FP0CX63 1770 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY2B-GR2P0CX64 1770 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY2B-CP25384 1770 aa-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP-0.11□□□□□ -2.43
RPC10YHR143W-A TY1B-NL1Q12112 1755 aa-0.11□□□□□ -2.43
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