RNA–Protein interactions for RNA: YER128W

VFA1, Transcript of Protein that interacts with Vps4p and has a role in vacuolar sorting, yeastyeast

Gene VFA1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VFA1YER128W ANS1P38832 159 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W GGC1P38988 300 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YAR068WP39564 161 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W DFG10P40526 253 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YFL012WP43580 148 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PIR5P46999 287 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W VPS25P47142 202 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YGL118CP53132 145 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YGL088WP53151 121 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PAU12P53343 120 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MIX14Q04341 121 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SPG4Q04438 115 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W ELP6Q04868 273 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SYM1Q06563 197 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PCL9Q12477 304 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YDR381C-AQ3E6R5 114 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YKL018C-AQ3E7A7 99 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W Q0010Q9ZZX9 128 aa2.76□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YHR139C-AO13536 103 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MDH2P22133 377 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W HSP12P22943 109 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPL16AP26784 199 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PAU2P32612 120 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W FZF1P32805 299 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SPG1P50088 95 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W UBC13P52490 153 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SWS2P53937 143 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YDR102CQ03864 110 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YOL160WQ08321 113 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YLR112WQ12130 139 aa2.75□□□□□ -1.97
VFA1YER128W NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.75□□□□□ -1.97not detected
VFA1YER128W YBL059WP34224 193 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MRPL27P36526 146 aaPredicted RBP2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MRPL39P36533 70 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PTH1P38876 190 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W TDA2P40045 126 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W CDC1P40986 491 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YPS5P53057 165 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YGL193CP53097 103 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W EMI1Q04406 187 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MCH4Q08268 501 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W CCH1P50077 2039 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PMD1P32634 1753 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W STT4P37297 1900 aa2.74□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MAK31P23059 88 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YKL044WP36092 106 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YNL217WP40152 326 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W KEG1P43614 200 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W IGO1P53897 168 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YMR295CQ03559 197 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W LPP1Q04396 274 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YDL242WQ07746 117 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YLR012CQ07927 99 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MIM1Q08176 113 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YDL211CQ12121 372 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W AYT1Q12226 474 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SMT3Q12306 101 aaKnown RBP2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YOR376W-AQ3E805 51 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RRT15Q3E811 62 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YLR365WQ7LIF2 110 aa2.73□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YAL064W-BO13512 126 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPS22AP0C0W1 130 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MRPL31P14063 131 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W IMP1P28627 190 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W RPL32P38061 130 aaKnown RBP2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YEL028WP39989 153 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YFL019CP43576 117 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YFR035CP43608 114 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W CIS3P47001 227 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W VPS55P47111 140 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PGU1P47180 361 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W YGR050CP53231 118 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W PIR1Q03178 341 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W MIX17Q03667 156 aa2.72□□□□□ -1.97
VFA1YER128W SOD1P00445 154 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W COX9P07255 59 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHR213WP0CI67 198 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W AGA2P32781 87 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W RSM18P40033 138 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YER187WP40102 141 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W BSC1Q12140 328 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W NAG1Q8TGN9 163 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YML100W-AQ8TGT0 57 aa2.71□□□□□ -1.98
VFA1YER128W CYR1P08678 2026 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W FPR2P32472 135 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YKR045CP36138 183 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YSY6P38374 65 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W TIM17P39515 158 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W HUR1P45820 110 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W BOL2P53082 120 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YIL014C-AQ02598 104 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W PIR3Q03180 325 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W ICY1Q04329 127 aa2.7□□□□□ -1.98
VFA1YER128W YOR186WQ08560 144 aa2.7□□□□□ -1.98
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