RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	RRT15	Q3E811	62 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	OST5	Q92316	86 aa		2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	CDC39	P25655	2108 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RTC6	O14464	93 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	SOD1	P00445	154 aa	Known RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YJL197C-A	P0C5P0	93 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	PAU2	P32612	120 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	MRPS9	P38120	278 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YFL051C	P43552	160 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YGL149W	P53116	101 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	DAD4	P69851	72 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RDS3	Q06835	107 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	CMC4	Q3E7A9	73 aa		2.76	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	SWR1	Q05471	1514 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	HSP150	P32478	413 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	SVP26	P38869	228 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	CYB5	P40312	120 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YDR042C	Q03205	200 aa		2.75	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-GR3	Q12316	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-OR	Q92393	1755 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	FAS2	P19097	1887 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	KRE1	P17260	313 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	NRG2	P38082	220 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YEL014C	P39999	101 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YIR020C	P40575	100 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YJR146W	P47174	117 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	VPS68	Q12016	184 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		2.74	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	UTR5	P32630	166 aa		2.73	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	HYR1	P40581	163 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	POP3	P53833	195 aa	Predicted RBP	2.73	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-DR5	P0C2I2	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-DR6	P0C2I3	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-LR2	P0C2I5	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-LR3	P0C2I6	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-PR1	P0C2I9	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-PR3	P0C2J1	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-JR1	P47098	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-ML2	Q03434	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-ER1	Q03612	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-ML1	Q04711	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-GR2	Q12269	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-OL	Q12273	1755 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	TY1B-PL	Q12414	1755 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YHR213W	P0CI67	198 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	PAU24	P38155	120 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	CWP2	P43497	92 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	AVO2	Q04749	426 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	YMR175W-A	Q3E766	64 aa		2.72	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	NUP159	P40477	1460 aa		2.71	□□□□□ -1.97
SLX8	YER116C	PAU19	P0CE85	124 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	PAU3	P25610	124 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YCR085W	P25650	117 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YHL005C	P38752	130 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YJL144W	P47009	104 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RGM1	Q00453	211 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	MET31	Q03081	177 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	SUS1	Q6WNK7	96 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	TY1B-DR4	Q07793	1604 aa		2.71	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	DNA2	P38859	1522 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	GDB1	Q06625	1536 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RPA12	P32529	125 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RPB7	P34087	171 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YHR022C	P38763	256 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YFL065C	P43539	102 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	SNN1	P48232	102 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	CYT2	Q00873	224 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YIL014C-A	Q02598	104 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YLR194C	Q05777	254 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YPR203W	Q08994	102 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	POC4	Q12245	148 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YLR363W-A	Q3E747	85 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	PCC1	Q3E833	88 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	BPT1	P14772	1559 aa		2.7	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RPL36B	O14455	100 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RPL36A	P05745	100 aa	Predicted RBP	2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	QCR8	P08525	94 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	ATG8	P38182	117 aa	RIP-Chip data	2.69	□□□□□ -1.98	not detected
SLX8	YER116C	DAN1	P47178	298 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	COA4	Q05809	96 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	EMC6	Q12431	108 aa		2.69	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	PAU16	P35994	123 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	COX23	P38824	151 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	PAU15	P40585	124 aa		2.68	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	SRX1	P36077	127 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	LSM2	P38203	95 aa	Known RBP	2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YBR013C	P38215	129 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	YBR027C	P38220	110 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	RSM18	P40033	138 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	ENV10	Q99382	181 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	SIN3	P22579	1536 aa		2.67	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	SCC2	Q04002	1493 aa		2.66	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	GCV3	P39726	170 aa	Predicted RBP	2.66	□□□□□ -1.98
SLX8	YER116C	ICY1	Q04329	127 aa		2.66	□□□□□ -1.98

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