RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W BNA2P47125 453 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W PFY1P07274 126 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W HMRA2P0CY13 119 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W UBC7Q02159 165 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W NUP53Q03790 475 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YOR029WQ12243 111 aa10.25□□□□□ -0.77
SSA4YER103W IMP2P46972 177 aa10.24□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YIP3P53633 176 aa10.24□□□□□ -0.77
SSA4YER103W MET32Q12041 191 aa10.24□□□□□ -0.77
SSA4YER103W SEN1Q00416 2231 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YDL022C-AP0C5L6 82 aa10.23□□□□□ -0.77
SSA4YER103W RPA12P32529 125 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YKR045CP36138 183 aa10.22□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YIP1P53039 248 aa10.22□□□□□ -0.77
SSA4YER103W COA3Q3E7B2 85 aa10.22□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YPL229WQ99395 206 aa10.22□□□□□ -0.77
SSA4YER103W RRT1P38192 103 aa10.21□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YDR209CQ03480 137 aa10.21□□□□□ -0.77
SSA4YER103W YMR105W-AQ8TGS8 64 aa10.21□□□□□ -0.77
SSA4YER103W TOA2P32774 122 aa10.2□□□□□ -0.78
SSA4YER103W RPS26AP39938 119 aaKnown RBP10.2□□□□□ -0.78
SSA4YER103W YNL217WP40152 326 aa10.2□□□□□ -0.78
SSA4YER103W PHO85P17157 305 aa10.19□□□□□ -0.78
SSA4YER103W TOS6P48560 102 aa10.19□□□□□ -0.78
SSA4YER103W TIM22Q12328 207 aa10.19□□□□□ -0.78
SSA4YER103W GLE2P40066 365 aa10.19□□□□□ -0.78
SSA4YER103W RPL39P04650 51 aa10.18□□□□□ -0.78
SSA4YER103W KRE1P17260 313 aa10.18□□□□□ -0.78
SSA4YER103W IGO2Q9P305 131 aa10.17□□□□□ -0.78
SSA4YER103W AGA1P32323 725 aa10.17□□□□□ -0.78
SSA4YER103W VTC1P40046 129 aaRIP-Chip data10.17□□□□□ -0.78not detected
SSA4YER103W YIR021W-AQ3E739 70 aa10.17□□□□□ -0.78
SSA4YER103W GAT3Q07928 141 aa10.15□□□□□ -0.78
SSA4YER103W YMR181CQ03231 154 aa10.15□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YAL063C-AQ3E791 96 aa10.15□□□□□ -0.79
SSA4YER103W VHS2P40463 436 aa10.14□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YJL027CP47063 138 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
SSA4YER103W KTI12P34253 313 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
SSA4YER103W SPI1P40092 148 aa10.13□□□□□ -0.79
SSA4YER103W AIM11P87275 137 aa10.12□□□□□ -0.79
SSA4YER103W RPS23AP0CX29 145 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W RPS23BP0CX30 145 aa10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YBL112CQ3E7Y4 105 aa10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W MOH1P38191 138 aa10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YER085CP40058 173 aa10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W FIP1P45976 327 aa10.11□□□□□ -0.79
SSA4YER103W IRA2P19158 3079 aa10.1□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YLR194CQ05777 254 aa10.1□□□□□ -0.79
SSA4YER103W YFL041W-AQ3E817 63 aa10.1□□□□□ -0.79
SSA4YER103W UGX2P32772 223 aa10.09□□□□□ -0.79
SSA4YER103W AIM34Q03673 198 aa10.09□□□□□ -0.79
SSA4YER103W RRG8Q06109 277 aa10.09□□□□□ -0.79
SSA4YER103W GLO1P50107 326 aa10.09□□□□□ -0.79
SSA4YER103W CSF1Q12150 2958 aa10.09□□□□□ -0.79
SSA4YER103W ADH5P38113 351 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
SSA4YER103W DSE2P38844 325 aa10.08□□□□□ -0.8
SSA4YER103W IRC23Q08416 157 aa10.08□□□□□ -0.8
SSA4YER103W RPS8AP0CX39 200 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SSA4YER103W RPS8BP0CX40 200 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
SSA4YER103W NRM1P53718 249 aa10.07□□□□□ -0.8
SSA4YER103W FCY1Q12178 158 aa10.07□□□□□ -0.8
SSA4YER103W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data10.07□□□□□ -0.8not detected
SSA4YER103W YPR053CQ6Q5F3 151 aa10.07□□□□□ -0.8
SSA4YER103W UTH1P36135 365 aa10.06□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YNL234WP53857 426 aa10.06□□□□□ -0.8
SSA4YER103W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa10.06□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YCR085WP25650 117 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W NRG2P38082 220 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W PRM7Q12459 698 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YFL051CP43552 160 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W ABF2Q02486 183 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W DAP1Q12091 152 aa10.05□□□□□ -0.8
SSA4YER103W CTR2P38865 189 aa10.04□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YGR039WP53225 103 aa10.04□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YOL160WQ08321 113 aa10.04□□□□□ -0.8
SSA4YER103W HFA1P32874 2273 aa10.04□□□□□ -0.8
SSA4YER103W MID2P36027 376 aa10.03□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YIA6P40556 373 aa10.03□□□□□ -0.8
SSA4YER103W URM1P40554 99 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SSA4YER103W SKI6P46948 246 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
SSA4YER103W YMR317WQ04893 1140 aa10.02□□□□□ -0.81
SSA4YER103W Q0255P03881 472 aa10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W ATP15P21306 62 aa10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W MSN1P22148 382 aa10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W DUO1P53168 247 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YLR361C-AQ3E795 98 aa10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W RPB10P22139 70 aa10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W MRPL38P35996 138 aaPredicted RBP10.01□□□□□ -0.81
SSA4YER103W MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
SSA4YER103W CWP2P43497 92 aa10□□□□□ -0.81
SSA4YER103W VPS55P47111 140 aa10□□□□□ -0.81
SSA4YER103W ENV10Q99382 181 aa10□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YDL186WP48568 277 aa9.99□□□□□ -0.81
SSA4YER103W ERF2Q06551 359 aa9.99□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YDL009CQ12210 107 aa9.99□□□□□ -0.81
SSA4YER103W YDR119W-AQ2V2P9 66 aa9.99□□□□□ -0.81
SSA4YER103W RPL28P02406 149 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
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