RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W YLR122CQ12312 125 aa8.41□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W DYN1P36022 4092 aa8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W RPL2AP0CX45 254 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W RPL2BP0CX46 254 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W FRS1P15624 595 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W SSS1P35179 80 aa8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W YLR281CQ05863 155 aa8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W YBR200W-AQ3E755 54 aa8.4□□□□□ -1.06
RNQ1YCL028W COX12Q01519 83 aa8.39□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W CMC2Q3E7A4 109 aa8.39□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W YDR366CP87287 132 aa8.38□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W DXO1Q06349 442 aa8.38□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W MED7Q08278 222 aa8.38□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W RPL16BP26785 198 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W YPR053CQ6Q5F3 151 aa8.37□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W SDH8P38345 138 aa8.36□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W CUE4Q04201 117 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W ELF1P36053 145 aa8.35□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W SEC72P39742 193 aaKnown RBP8.35□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W BRP1P53194 125 aa8.35□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W TVP18Q04767 167 aa8.35□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W YKR032WP36127 104 aa8.34□□□□□ -1.07
RNQ1YCL028W RRT13P40042 185 aa8.33□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W VHS2P40463 436 aa8.33□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YGL118CP53132 145 aa8.33□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W AIM34Q03673 198 aa8.33□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W CYC7P00045 113 aa8.32□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W NRG2P38082 220 aa8.32□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W PET8P38921 284 aa8.32□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YER134CP40081 178 aa8.32□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W SEN15Q04675 128 aa8.31□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YCR001WP25347 104 aa8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W GSP1P32835 219 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W GSP2P32836 220 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W KTI12P34253 313 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YNL200CP40165 246 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YCH1P42937 148 aa8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W OST3P48439 350 aa8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YCR075W-AQ3E830 75 aa8.3□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W TEM1P38987 245 aa8.29□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YLR042CQ07990 161 aa8.29□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YPR014CQ6B0W2 109 aa8.29□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W MRPL11P36521 249 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W YIL134C-AQ45U18 67 aa8.28□□□□□ -1.08
RNQ1YCL028W SAL1D6W196 494 aa8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W ATP23P53722 227 aa8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YIL014C-AQ02598 104 aa8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W ERG27Q12452 347 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W COA6Q3E846 104 aa8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa8.27□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YER076CP40049 302 aa8.26□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YPS5P53057 165 aa8.26□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W PFY1P07274 126 aa8.24□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YCR023CP25351 611 aa8.24□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YNL217WP40152 326 aa8.24□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W RDS3Q06835 107 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W HTL1Q9URQ5 78 aa8.24□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W CDC40P40968 455 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W DCV1P43595 202 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YJL028WP47062 111 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W GLO1P50107 326 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W MGR2Q02889 113 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W SGF11Q03067 99 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W VAM10Q08474 114 aa8.23□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W PRE1P22141 198 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W AUA1P32450 94 aa8.22□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W SCW10Q04951 389 aa8.22□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W DGA1Q08650 418 aa8.22□□□□□ -1.09
RNQ1YCL028W YRA2P36036 203 aaKnown RBP RIP-Chip data8.21□□□□□ -1.1not detected
RNQ1YCL028W POP3P53833 195 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W AQY1P0CD91 305 aa8.2□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W YKR070WP36151 352 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W ERV14P53173 138 aa8.2□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W DPP1Q05521 289 aa8.2□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W PCL2P25693 308 aa8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W PAU16P35994 123 aa8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W KRE9P39005 276 aa8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W CGR1P53188 120 aa8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W YGR240C-AQ3E786 66 aa8.19□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W YPT53P36019 220 aa8.18□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W PMP3P87284 55 aa8.18□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W HAL1Q01766 294 aa8.18□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W TOS6P48560 102 aa8.17□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W CNL1Q06333 122 aa8.17□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W LSM8P47093 109 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W YDR042CQ03205 200 aa8.16□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W YOR008C-AQ3E7B9 74 aa8.16□□□□□ -1.1
RNQ1YCL028W RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W HMRA2P0CY13 119 aa8.14□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W TPT1Q12272 230 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W UBC5P15732 148 aa8.13□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W FUN14P18411 198 aa8.13□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W FYV4P38783 130 aaPredicted RBP8.13□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W PKR1Q03880 122 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RNQ1YCL028W CRC1Q12289 327 aa8.13□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.6 ms