RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000628306.2

CAPNS1-216, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-216ENST00000628306 MRPL44Q9H9J2 332 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 OBP2AQ9NY56 170 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ASB3Q9Y575 518 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa25.88■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 TRIM49BA6NDI0 452 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ18B7U540 433 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SCP2P22307 547 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 WEE1P30291 646 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 LILRA4P59901 499 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 TNK2Q07912 1038 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 KCNJ12Q14500 433 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PON2Q15165 354 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 NFIL3Q16649 462 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 DGKKQ5KSL6 1271 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PKN3Q6P5Z2 889 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 FAM160A2Q8N612 972 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM174Q8WUU8 243 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 FRYQ5TBA9 3013 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GNA14O95837 355 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PIGRP01833 764 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GABRR2P28476 465 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ALDH1A3P47895 512 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SMTNP53814 917 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GSDMDP57764 484 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC39A4Q6P5W5 647 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 DSTYKQ6XUX3 929 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 USP37Q86T82 979 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 WDR5BQ86VZ2 330 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 VSTM4Q8IW00 320 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SENP8Q96LD8 212 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 LPIN3Q9BQK8 851 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ATF6P18850 670 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ABCD1P33897 745 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SCN1AP35498 2009 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP2R3AQ06190 1150 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 KRT31Q15323 416 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GPR158Q5T848 1215 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 HAUS6Q7Z4H7 955 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GLIS3Q8NEA6 775 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ATXN3LQ9H3M9 355 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 HSFX1Q9UBD0 423 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CHD6Q8TD26 2715 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP11A1P05108 521 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 SNRPFP62306 86 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CYP4F8P98187 520 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 INTS13Q9NVM9 706 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 TBC1D7Q9P0N9 293 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GREB1Q4ZG55 1949 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 ANO9A1A5B4 782 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PIRO00625 290 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 OGTO15294 1046 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CALUO43852 315 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 EXTL3O43909 919 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 PPP1R37O75864 691 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CDR1P51861 262 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 COPB1P53618 953 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 MARSP56192 900 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 JADE1Q6IE81 842 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 GOLGA5Q8TBA6 731 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 TASP1Q9H6P5 420 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-216ENST00000628306 A0A0B4J269 797 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TM4SF5O14894 197 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 NFICP08651 508 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 PBX1P40424 430 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CASP5P51878 434 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 C9orf57Q5W0N0 161 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TMEM150AQ86TG1 271 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SYNPOQ8N3V7 929 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SPC24Q8NBT2 197 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 BPIFB1Q8TDL5 484 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HVCN1Q96D96 273 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TSPAN18Q96SJ8 248 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SLC46A2Q9BY10 475 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ZCWPW1Q9H0M4 648 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RXFP3Q9NSD7 469 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TBX20Q9UMR3 447 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SPAG17Q6Q759 2223 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 GCNT3O95395 438 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 TPM2P07951 284 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RPL13P26373 211 aaKnown RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 HOXD13P35453 343 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 CCDC186Q7Z3E2 898 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 LRRTM3Q86VH5 581 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 ZSCAN30Q86W11 494 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 RIN3Q8TB24 985 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-216ENST00000628306 BICD1Q96G01 975 aa25.82■■□□□ 1.72
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