RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000593200.5

EFTUD2-226, Transcript of elongation factor Tu GTP binding domain containing 2, humanhuman

TSL 3

Gene EFTUD2, Length 485 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2-226ENST00000593200 SV2BQ7L1I2 683 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ADGRF2Q8IZF7 708 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TOP6BLQ8N6T0 577 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NUP205Q92621 2012 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ACDQ96AP0 544 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CYP2S1Q96SQ9 504 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CBWD1Q9BRT8 395 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MTMR12Q9C0I1 747 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GCNT4Q9P109 453 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EBF1Q9UH73 591 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CLIC4Q9Y696 253 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 WNT6Q9Y6F9 365 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 USP24Q9UPU5 2620 aa11.05□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FRMD3A2A2Y4 597 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8IPA6NC78 632 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 C2orf78A6NCI8 922 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GOLGA8JA6NMD2 632 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MAGEA11P43364 429 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RBP5P82980 135 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SHC2P98077 582 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNB1Q14721 858 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ELF2Q15723 593 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SOWAHAQ2M3V2 549 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TCEAL6Q6IPX3 200 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FAM171BQ6P995 826 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DPH6Q7L8W6 267 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SCN4BQ8IWT1 228 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SYCP3Q8IZU3 236 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FSIP1Q8NA03 581 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TTC16Q8NEE8 873 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SH3RF2Q8TEC5 729 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TCEAL3Q969E4 200 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE11AQ9HCR9 933 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 FRYQ5TBA9 3013 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 DCLK1O15075 740 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RHOBTB1O94844 696 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KCNK5O95279 499 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NFATC1O95644 943 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 IDEP14735 1019 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 HDCP19113 662 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 TXLNAP40222 546 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PDE6CP51160 858 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CREB5Q02930 508 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 MYO1EQ12965 1108 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NR1H3Q13133 447 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMD2Q13200 908 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 RNF43Q68DV7 783 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 C4orf50Q6ZRC1 276 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LIMS2Q7Z4I7 341 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 GPD1LQ8N335 351 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC26Q8TAB7 109 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SPATA17Q96L03 361 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CEP295NLQ96MC4 621 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CLIC6Q96NY7 704 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 SYT15Q9BQS2 421 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 EDEM2Q9BV94 578 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 LINC00597Q9H2U6 94 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PCIF1Q9H4Z3 704 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 INTS13Q9NVM9 706 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 CDH9Q9ULB4 789 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 ABCA7Q8IZY2 2146 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 PTPRJQ12913 1337 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 THADAQ6YHU6 1953 aa11.03□□□□□ -0.64
EFTUD2-226ENST00000593200 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ATP2C2O75185 946 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CAVIN2O95810 425 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PFKLP17858 780 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 LMO2P25791 158 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 OPRD1P41143 372 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 DGKEP52429 567 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 ZXDBP98169 803 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 GAB4Q2WGN9 574 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 VSTM1Q6UX27 236 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 RASSF3Q86WH2 238 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 TSTD1Q8NFU3 115 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 OR5B17Q8NGF7 314 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 USP33Q8TEY7 942 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 MYLPFQ96A32 169 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 CRTAC1Q9NQ79 661 aa11.02□□□□□ -0.65
EFTUD2-226ENST00000593200 PANK4Q9NVE7 773 aa11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms