RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 PPM1KQ8N3J5 372 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FIBCD1Q8N539 461 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TTC9BQ8N6N2 239 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 C12orf29Q8N999 325 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SLC4A11Q8NBS3 891 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 STKLD1Q8NE28 680 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 GDPD5Q8WTR4 605 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SLC20A1Q8WUM9 679 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CPLX3Q8WVH0 158 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZBP1Q9H171 429 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CHST7Q9NS84 486 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CNTN6Q9UQ52 1028 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP8.87□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 A0A0U1RQJ8 604 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TTLL8A6PVC2 850 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 HIDE1A8MVS5 230 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CYB561D2O14569 222 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FGF18O76093 207 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CYP11A1P05108 521 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 BMP1P13497 986 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CDC25BP30305 580 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CTNNB1P35222 781 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 MRE11P49959 708 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 NDST1P52848 882 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ERVK-21P61565 698 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 GCNT1Q02742 428 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF394Q53GI3 561 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF667Q5HYK9 610 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FAM171A1Q5VUB5 890 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SLC47A2Q86VL8 602 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SPPL3Q8TCT6 385 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CACTINQ8WUQ7 758 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 UROC1Q96N76 676 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF558Q96NG5 402 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 NT5C1BQ96P26 610 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TSPAN18Q96SJ8 248 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ANP32EQ9BTT0 268 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 KCNF1Q9H3M0 494 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CISHQ9NSE2 258 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CYTH4Q9UIA0 394 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FAN1Q9Y2M0 1017 aa8.86□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 COL4A3Q01955 1670 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 MYBPHLA2RUH7 354 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TULP2O00295 520 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CYP26A1O43174 497 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 STX10O60499 249 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 MFAP3LO75121 409 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 GFPT2O94808 682 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 PDGFRBP09619 1106 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SKILP12757 684 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CCDC130P13994 396 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 LAG3P18627 525 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 WARSP23381 471 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ATICP31939 592 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 BMPR1AP36894 532 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TRPC3Q13507 836 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 RAPGEF1Q13905 1077 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 MTF1Q14872 753 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 PTPN14Q15678 1187 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 SV2CQ496J9 727 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FIGNQ5HY92 759 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FKBP15Q5T1M5 1219 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM46Q7Z4K8 759 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ACOT1Q86TX2 421 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 FAM71AQ8IYT1 594 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ADGRF2Q8IZF7 708 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TOP6BLQ8N6T0 577 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 VN1R2Q8NFZ6 395 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 RNF217Q8TC41 542 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF560Q96MR9 790 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHB18PQ96TA0 734 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CHP1Q99653 195 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CLSTN3Q9BQT9 956 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 CEP72Q9P209 647 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa8.85□□□□□ -0.99
TMOD3-211ENST00000561438 TJP2Q9UDY2 1190 aa8.85□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.7 ms