RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NOMO1	Q15155	1222 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	IFIT1B	Q5T764	474 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF529	Q6P280	563 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	C16orf54	Q6UWD8	224 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DLK2	Q6UY11	383 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MAATS1	Q7Z4T9	603 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZGPAT	Q8N5A5	531 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SMRP1	Q8NCR6	262 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX55	Q8NHQ9	600 aa	Known RBP eCLIP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PARD3B	Q8TEW8	1205 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	HPS3	Q969F9	1004 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NELL2	Q99435	816 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OSBPL5	Q9H0X9	879 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	WWOX	Q9NZC7	414 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LRCH1	Q9Y2L9	728 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR52	Q9Y2T5	361 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA9	Q9Y5G4	932 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA8	Q9Y5G5	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA7	Q9Y5G6	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA6	Q9Y5G7	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA3	Q9Y5H0	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGA2	Q9Y5H1	932 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		3.3	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		A6NNZ2	444 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ERVV-2	B6SEH9	535 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLIM4	O00461	696 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AP1G1	O43747	822 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TUSC2	O75896	110 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ENDOD1	O94919	500 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GPANK1	O95872	356 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	HSP90AB1	P08238	724 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	POU2F2	P09086	479 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFAIP3	P21580	790 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FOLR3	P41439	243 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLC5A3	P53794	718 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NUCB1	Q02818	461 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TNFAIP2	Q03169	654 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SLFN5	Q08AF3	891 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CCDC184	Q52MB2	194 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SPATA1	Q5VX52	437 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CYP26C1	Q6V0L0	522 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	UBE3B	Q7Z3V4	1068 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0319L	Q8IZA0	1049 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OR2C3	Q8N628	320 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957		Q8NA96	180 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	SEMA6D	Q8NFY4	1073 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DIS3L	Q8TF46	1054 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TRIM63	Q969Q1	353 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	C1GALT1C1	Q96EU7	318 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	LRGUK	Q96M69	825 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CRB3	Q9BUF7	120 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ADI1	Q9BV57	179 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	REXO4	Q9GZR2	422 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NUP62CL	Q9H1M0	184 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM140	Q9NV12	185 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PADI4	Q9UM07	663 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PCDHGB3	Q9Y5G1	929 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		3.29	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FAM170A	A1A519	330 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	FOXN3	O00409	490 aa	Predicted RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NCAM2	O15394	837 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TEX33	O43247	280 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	PEX1	O43933	1283 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	GPR32	O75388	356 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	BAIAP3	O94812	1187 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AGR2	O95994	175 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CKB	P12277	381 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CAPN3	P20807	821 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	AGXT	P21549	392 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RPS6KB1	P23443	525 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	VAV2	P52735	878 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNB3	P54284	484 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NOMO3	P69849	1222 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	KIF22	Q14807	665 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	MIDN	Q504T8	468 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	NOMO2	Q5JPE7	1267 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	RETSAT	Q6NUM9	610 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	DARS2	Q6PI48	645 aa	Known RBP	3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	OVCH2	Q7RTZ1	564 aa		3.28	□□□□□ -1.88
AKAP13-223	ENST00000560957	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		3.28	□□□□□ -1.88

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