RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556749.1

TTC7B-210, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7B, human

TSL 4

Gene TTC7B, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TTC7B-210	ENST00000556749	SEMA4G	Q9NTN9	838 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MORC2	Q9Y6X9	1032 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CYB561D2	O14569	222 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TRDMT1	O14717	391 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	XPOT	O43592	962 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	EXTL3	O43909	919 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NOL4	O94818	638 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ODC1	P11926	461 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PLCG1	P19174	1290 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GABRR2	P28476	465 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GJB2	P29033	226 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CDC25C	P30307	473 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ABCD1	P33897	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DDIT3	P35638	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LONP1	P36776	959 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RAP1GAP	P47736	663 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MCM2	P49736	904 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ACOT2	P49753	483 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TAF6	P49848	677 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LIG4	P49917	911 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KPNA1	P52294	538 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LIMK1	P53667	647 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NLRP12	P59046	1061 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CYP4F8	P98187	520 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KCNA1	Q09470	495 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LRRC32	Q14392	662 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MCM6	Q14566	821 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TMEM132D	Q14C87	1099 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RABEP1	Q15276	862 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LPAL2	Q16609	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	WSCD1	Q658N2	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PRR23C	Q6ZRP0	262 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LYSMD3	Q7Z3D4	306 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP37	Q86T82	979 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ITIH5	Q86UX2	942 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MON1A	Q86VX9	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NT5DC4	Q86YG4	428 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	PDCL2	Q8N4E4	241 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYCT1	Q8N699	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZSWIM2	Q8NEG5	633 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	NETO1	Q8TDF5	533 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	BPIFB1	Q8TDL5	484 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CSGALNACT1	Q8TDX6	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LARP4B	Q92615	738 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LOXL4	Q96JB6	756 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	HINFP	Q9BQA5	517 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MSTO1	Q9BUK6	570 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ATXN3L	Q9H3M9	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GKN1	Q9NS71	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GDAP2	Q9NXN4	497 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GCNT4	Q9P109	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZMYM5	Q9UJ78	669 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GMEB2	Q9UKD1	530 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	L1RE1	Q9UN81	338 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CCL26	Q9Y258	94 aa		4.88	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	MYMK	A6NI61	221 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KPNA7	A9QM74	516 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749		K7ENM7	598 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GABRD	O14764	452 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FOXD2	O60548	495 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	AKAP3	O75969	853 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	KRT37	O76014	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	FAM13A	O94988	1023 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	BMP15	O95972	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZNF806	P0C7X5	589 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	TCF3	P15923	654 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	UBA7	P41226	1012 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ABL2	P42684	1182 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	GPR15	P49685	360 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CASP5	P51878	434 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	ZXDB	P98169	803 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	POU4F2	Q12837	409 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	CUL4A	Q13619	759 aa		4.87	□□□□□ -1.63
TTC7B-210	ENST00000556749	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63

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