RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539305.1

AP002991.1-201, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene AP002991.1, Length 574 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP002991.1-201ENST00000539305 RESP18Q5W5W9 173 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 IQUBQ8NA54 791 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TTC16Q8NEE8 873 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SYT15Q9BQS2 421 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 RNF38Q9H0F5 515 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 XYLT2Q9H1B5 865 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TRPC7Q9HCX4 862 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ABCB6Q9NP58 842 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 NCDNQ9UBB6 729 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 RCOR1Q9UKL0 485 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 WNT6Q9Y6F9 365 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MYO16Q9Y6X6 1858 aa9.01□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CLDN5O00501 218 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TNNC2P02585 160 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CSH1P0DML2 217 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CSH2P0DML3 217 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 WARSP23381 471 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GJA4P35212 333 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 AVPR1AP37288 418 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 LHX1P48742 406 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PGFP49763 221 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CCR3P51677 355 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CDH8P55286 799 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 DLG4P78352 724 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MESP2Q0VG99 397 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PSMD6Q15008 389 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF77Q15935 545 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GAB4Q2WGN9 574 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TMEM196Q5HYL7 178 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MDH1BQ5I0G3 518 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 DGKKQ5KSL6 1271 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PAQR9Q6ZVX9 377 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 UNC13DQ70J99 1090 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 DPH6Q7L8W6 267 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 WDR49Q8IV35 697 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SFTPA1Q8IWL2 248 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 KIAA0895Q8NCT3 520 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PAGE5Q96GU1 130 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PCED1BQ96HM7 432 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GCNAQ96QF7 691 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MMS19Q96T76 1030 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CGRRF1Q99675 332 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 B3GNT5Q9BYG0 378 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 FAM126AQ9BYI3 521 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SDCBP2Q9H190 292 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CUEDC2Q9H467 287 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CDH9Q9ULB4 789 aa9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 FRYQ5TBA9 3013 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 A0A1B0GVL5 298 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 F8VP50 259 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GDF9O60383 454 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PAPSS2O95340 614 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 VNN1O95497 513 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 HDCP19113 662 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TNNI1P19237 187 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 KCNA4P22459 653 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 GRIK1P39086 918 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MAGEA11P43364 429 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 RAP1GAPP47736 663 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ME1P48163 572 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PLCB2Q00722 1185 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CYP27A1Q02318 531 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MYO1EQ12965 1108 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SIM2Q14190 667 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 LRRC32Q14392 662 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MTF1Q14872 753 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 CCDC6Q16204 474 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 BMT2Q1RMZ1 405 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 EML3Q32P44 896 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 C1orf220Q5T0J3 134 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 PRR23BQ6ZRT6 265 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 ERMP1Q7Z2K6 904 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 DGLUCYQ7Z3D6 616 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 XXYLT1Q8NBI6 393 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 OR6B3Q8NGW1 331 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.99□□□□□ -0.97
AP002991.1-201ENST00000539305 WBP2Q969T9 261 aa8.99□□□□□ -0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17 ms