RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515746.5

ATXN3-212, Transcript of ataxin 3, human

TSL 5

Gene ATXN3, Length 619 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATXN3-212	ENST00000515746	STBD1	O95210	358 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZWINT	O95229	277 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CBX6	O95503	412 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CCNE2	O96020	404 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LMNA	P02545	664 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NPR1	P16066	1061 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PECAM1	P16284	738 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TSHR	P16473	764 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ATP4A	P20648	1035 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GART	P22102	1010 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MARK3	P27448	753 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTPN4	P29074	926 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EPHB2	P29323	1055 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CDC25C	P30307	473 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SCNN1A	P37088	669 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ECE1	P42892	770 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NPTX2	P47972	431 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PTDSS1	P48651	473 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VPS41	P49754	854 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TUB	P50607	506 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NEK3	P51956	506 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	STAT2	P52630	851 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RAD23B	P54727	409 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VCP	P55072	806 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	GPX6	P59796	221 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	BPIFB4	P59827	614 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NOMO3	P69849	1222 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MRPS35	P82673	323 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RNASEL	Q05823	741 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MCL1	Q07820	350 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ZNF252P-AS1	Q0IIN9	211 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMD6	Q15008	389 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAPK6	Q16659	721 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	AOC3	Q16853	763 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	P3H1	Q32P28	736 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LIN9	Q5TKA1	542 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	OR52E8	Q6IFG1	317 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	IRGC	Q6NXR0	463 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RFWD3	Q6PCD5	774 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC174	Q6PII3	467 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SH2D5	Q6ZV89	423 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PODN	Q7Z5L7	613 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	APBB1IP	Q7Z5R6	666 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NLRX1	Q86UT6	975 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM160B2	Q86V87	743 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	LDHD	Q86WU2	507 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CHSY1	Q86X52	802 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C4orf19	Q8IY42	314 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	RCOR2	Q8IZ40	523 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ALDH16A1	Q8IZ83	802 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	BANP	Q8N9N5	519 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLC35B2	Q8TB61	432 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MICAL1	Q8TDZ2	1067 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CHURC1	Q8WUH1	139 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	BSND	Q8WZ55	320 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	COL26A1	Q96A83	441 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SKA1	Q96BD8	255 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ELMO3	Q96BJ8	720 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SYT15	Q9BQS2	421 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MAK16	Q9BXY0	300 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	MMADHC	Q9H3L0	296 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PCDH9	Q9HC56	1237 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PDLIM7	Q9NR12	457 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	KCNH7	Q9NS40	1196 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	PSMC3IP	Q9P2W1	217 aa	Predicted RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DNPEP	Q9ULA0	475 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		5.23	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	UBR3	Q6ZT12	1888 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	hCG_1818297	A0A087WSY0	165 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746		A0A1W2PPM1	405 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	DENND3	A2RUS2	1198 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TMEM150B	A6NC51	233 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	C3orf70	A6NLC5	250 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NDC80	O14777	642 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HGS	O14964	777 aa	Predicted RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	ENTPD5	O75356	428 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	TGDS	O95455	350 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	VNN1	O95497	513 aa		5.22	□□□□□ -1.57
ATXN3-212	ENST00000515746	HLA-DRA	P01903	254 aa		5.22	□□□□□ -1.57

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