RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512331.5

RUFY3-210, Transcript of RUN and FYVE domain containing 3, humanhuman

TSL 3

Gene RUFY3, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF354CQ86Y25 554 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TBC1D22AQ8WUA7 517 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 WDR92Q96MX6 357 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 STARD7Q9NQZ5 370 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KCND1Q9NSA2 647 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PNPOQ9NVS9 261 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ANAPC4Q9UJX5 808 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PADI4Q9UM07 663 aa7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ROBO3Q96MS0 1386 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 BAG4O95429 457 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 LDHCP07864 332 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FURINP09958 794 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TYRP14679 529 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SYN1P17600 705 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ABCB4P21439 1286 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PPM1AP35813 382 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PER3P56645 1201 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF543Q08ER8 600 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 RAB39AQ14964 217 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 MST1LQ2TV78 715 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CCDC93Q567U6 631 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 IZUMO3Q5VZ72 239 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CTR9Q6PD62 1173 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SAPCD2Q86UD0 394 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 IRF2BP1Q8IU81 584 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 UNC5BQ8IZJ1 945 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FBXL16Q8N461 479 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SH2D3CQ8N5H7 860 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PAF1Q8N7H5 531 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TTLL6Q8N841 843 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 IL31RAQ8NI17 732 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SNX33Q8WV41 574 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ANKS1AQ92625 1134 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KIAA1191Q96A73 305 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ZSWIM3Q96MP5 696 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CLIC6Q96NY7 704 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 WRNIP1Q96S55 665 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ARPP21Q9UBL0 812 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FBXO10Q9UK96 956 aa7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 A0A0G2JNJ9 132 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 HRKO00198 91 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PPIP5K2O43314 1243 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 NCK2O43639 380 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CTDNEP1O95476 244 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SYT1P21579 422 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 POLD1P28340 1107 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SLC7A1P30825 629 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 STT3AP46977 705 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SLC6A9P48067 706 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 EVCP57679 992 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KIAA2012Q0VF49 1180 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SBK1Q52WX2 424 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FAM209BQ5JX69 171 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FYB2Q5VWT5 728 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ABHD15Q6UXT9 468 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 GADL1Q6ZQY3 521 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 MFSD6Q6ZSS7 791 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 MAPKAPK5Q8IW41 473 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 TEX11Q8IYF3 940 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CCT6BQ92526 530 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 MRGPRX4Q96LA9 322 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 DMRTA2Q96SC8 542 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 VRK1Q99986 396 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 KRT23Q9C075 422 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 LY9Q9HBG7 655 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PNPLA8Q9NP80 782 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CASS4Q9NQ75 786 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 ATP8A2Q9NTI2 1148 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 Q9UFV3 132 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 CDC23Q9UJX2 597 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 PARP14Q460N5 1801 aa7.35□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 NID2Q14112 1375 aa7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 DOCK1Q14185 1865 aa7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 FLT1P17948 1338 aa7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 OTOFQ9HC10 1997 aa7.34□□□□□ -1.23
RUFY3-210ENST00000512331 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa7.34□□□□□ -1.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.2 ms