RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511807.1

UBE2B-208, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 818 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-208ENST00000511807 MICAL2O94851 1124 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ADCY5O95622 1261 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 LRPAP1P30533 357 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GDI1P31150 447 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 VIPR2P41587 438 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MAGEA9P43362 315 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF75DP51815 510 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GUCY2FP51841 1108 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RBP5P82980 135 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 EXOC3L4Q17RC7 722 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF528Q3MIS6 628 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CBWD6Q4V339 395 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 WDR44Q5JSH3 913 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CBWD3Q5JTY5 395 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CBWD5Q5RIA9 395 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TSSK4Q6SA08 328 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 LEMD2Q8NC56 503 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 EHBP1Q8NDI1 1231 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ATRIPQ8WXE1 791 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SMARCD2Q92925 531 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ERGIC2Q96RQ1 377 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 IMPG2Q9BZV3 1241 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MTMR12Q9C0I1 747 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RAB20Q9NX57 234 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MAFFQ9ULX9 164 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 COQ4Q9Y3A0 265 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 YIPF1Q9Y548 306 aa12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP12.11□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SPTLC1O15269 473 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 AP5Z1O43299 807 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MOSPD3O75425 235 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OAZ2O95190 189 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 HLA-DRAP01903 254 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 KRT19P08727 400 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PSMC3P17980 439 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ATICP31939 592 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PIK3CAP42336 1068 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RPS9P46781 194 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NCOA4Q13772 614 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TEAD2Q15562 447 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 VITQ6UXI7 678 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 C1orf127Q8N9H9 656 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SUMF1Q8NBK3 374 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TAF4BQ92750 862 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 IRF7Q92985 503 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CLDN23Q96B33 292 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 RMDN1Q96DB5 314 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 IQCDQ96DY2 449 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CRACR2AQ9BSW2 395 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NUP58Q9BVL2 599 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 GCNT4Q9P109 453 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NCDNQ9UBB6 729 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP12.1□□□□□ -0.475e-12■■□□□ 13
UBE2B-208ENST00000511807 PTPRJQ12913 1337 aa12.1□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 A0A1W2PRU2 124 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OR6C75A6NL08 312 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SHISA7A6NL88 538 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MAN2B1O00754 1011 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PPEF2O14830 753 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF263O14978 683 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CLSTN1O94985 981 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 VNN2O95498 520 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ITGB3P05106 788 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PAX3P23760 479 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PNPLA4P41247 253 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ALDH1A3P47895 512 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 AARSP49588 968 aaKnown RBP eCLIP12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 EPHB3P54753 998 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 EPHA5P54756 1037 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MYO1EQ12965 1108 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DUSP4Q13115 394 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 MTAPQ13126 283 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PLD1Q13393 1074 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SYCP1Q15431 976 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OVOS1Q6IE37 1185 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DRC7Q8IY82 874 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NEK11Q8NG66 645 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SHKBP1Q8TBC3 707 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 TAS1R2Q8TE23 839 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FAM3CQ92520 227 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 FAM81BQ96LP2 452 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 NT5C1BQ96P26 610 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CRISPLD1Q9H336 500 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PLCB1Q9NQ66 1216 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 ZSCAN32Q9NX65 697 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 AGAP1Q9UPQ3 857 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 SLC27A5Q9Y2P5 690 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 PIAS3Q9Y6X2 628 aa12.09□□□□□ -0.47
UBE2B-208ENST00000511807 CFAP54Q96N23 3096 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 HEPACAM2A8MVW5 462 aa12.08□□□□□ -0.48
UBE2B-208ENST00000511807 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa12.08□□□□□ -0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.8 ms