RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504823.5

FAM200B-208, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

TSL 3

Gene FAM200B, Length 635 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-208	ENST00000504823	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	TTC8	Q8TAM2	541 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	SENP8	Q96LD8	212 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC46A2	Q9BY10	475 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	VPS45	Q9NRW7	570 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	RXFP3	Q9NSD7	469 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	DSE	Q9UL01	958 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	DERA	Q9Y315	318 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		10.65	□□□□□ -0.7
FAM200B-208	ENST00000504823	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	10.65	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ANO9	A1A5B4	782 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PP2D1	A8MPX8	630 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PPEF2	O14830	753 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	OGT	O15294	1046 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PROS1	P07225	676 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	RHOQ	P17081	205 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	DRD1	P21728	446 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	MPL	P40238	635 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TNFSF9	P41273	254 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC12A3	P55017	1021 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	POU5F1	Q01860	360 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SPAG1	Q07617	926 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	VEPH1	Q14D04	833 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PKN3	Q6P5Z2	889 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CMTM8	Q8IZV2	173 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TTC9B	Q8N6N2	239 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PNMA5	Q96PV4	448 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	GCNA	Q96QF7	691 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	LPIN3	Q9BQK8	851 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CCSER1	Q9C0I3	900 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	HPS4	Q9NQG7	708 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	LARS	Q9P2J5	1176 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	EBF1	Q9UH73	591 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC8A2	Q9UPR5	921 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PCDHB6	Q9Y5E3	794 aa		10.64	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	EML5	Q05BV3	1969 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	OTOL1	A6NHN0	477 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC26A4	O43511	780 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SOAT2	O75908	522 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	F11	P03951	625 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC192	P0DO97	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	HAPLN1	P10915	354 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ABCD1	P33897	745 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	GPC1	P35052	558 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	GUCY2F	P51841	1108 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CYP4F8	P98187	520 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	GNL2	Q13823	731 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	KARS	Q15046	597 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PLK5	Q496M5	336 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	FBXO43	Q4G163	708 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SLC39A12	Q504Y0	691 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	EXOC4	Q96A65	974 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	GKN1	Q9NS71	199 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CUEDC1	Q9NWM3	386 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CPSF3	Q9UKF6	684 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ODF2L	Q9ULJ1	636 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TBX20	Q9UMR3	447 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	C2CD2	Q9Y426	696 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	MYH11	P35749	1972 aa		10.63	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823		A0A0B4J269	797 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	RHOBTB1	O94844	696 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PLA2G4B	P0C869	781 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	HMGA1	P17096	107 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	AVPR1A	P37288	418 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	MATR3	P43243	847 aa	Known RBP eCLIP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PXN	P49023	591 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	LIG4	P49917	911 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ZNF131	P52739	623 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	NLRP12	P59046	1061 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ATP2C1	P98194	919 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	PDGFRL	Q15198	375 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CCDC6	Q16204	474 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	MGAT5B	Q3V5L5	792 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TMEM119	Q4V9L6	283 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ARSH	Q5FYA8	562 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	RNF43	Q68DV7	783 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	JADE1	Q6IE81	842 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SYT13	Q7L8C5	426 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	CYP2U1	Q7Z449	544 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	C11orf74	Q86VG3	221 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	BICD1	Q96G01	975 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	SEPT5	Q99719	369 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	ASB7	Q9H672	318 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	TDP1	Q9NUW8	608 aa		10.62	□□□□□ -0.71
FAM200B-208	ENST00000504823	WASF3	Q9UPY6	502 aa		10.62	□□□□□ -0.71

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.1 ms