RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497648.1

RABGGTB-214, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2

Gene RABGGTB, Length 1,319 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-214ENST00000497648 SRGAP2O75044 1071 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ENDOD1O94919 500 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT6AP02538 564 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KRT6BP04259 564 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8HP0CJ92 632 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PORP16435 677 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NAGAP17050 411 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LSP1P33241 339 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SERPINB6P35237 376 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ADCY8P40145 1251 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GSK3AP49840 483 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TGFB2P61812 414 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GNAI1P63096 354 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TMPRSS15P98073 1019 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GAS6Q14393 721 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GALNT3Q14435 633 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GBX1Q14549 363 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RNFT1Q5M7Z0 435 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR73Q6P4I2 378 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 AAGABQ6PD74 315 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 XKR5Q6UX68 686 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NECAB2Q7Z6G3 386 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TSPYL6Q8N831 410 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ATP8B4Q8TF62 1192 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CMTM3Q96MX0 182 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NT5C1BQ96P26 610 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EYA3Q99504 573 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CIB1Q99828 191 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SIKE1Q9BRV8 207 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 BABAM1Q9NWV8 329 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HSPBP1Q9NZL4 362 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 STK38LQ9Y2H1 464 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR52Q9Y2T5 361 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 LEMD3Q9Y2U8 911 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa9.21□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CACNA1SQ13698 1873 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1B0GWJ7 208 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SH3D21A4FU49 640 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 KIF28PB7ZC32 967 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HSBP1L1C9JCN9 74 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CLN5O75503 358 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP9.2□□□□□ -0.941e-14■■■■□ 21.2
RABGGTB-214ENST00000497648 NFKBIAP25963 317 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ALDH3A1P30838 453 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GNAQP50148 359 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CLCN4P51793 760 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8FQ08AF8 430 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ASPHQ12797 758 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PTK2BQ14289 1009 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ECM1Q16610 540 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PTPN21Q16825 1174 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HADHQ16836 314 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXW10Q5XX13 1052 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TTC23LQ6PF05 361 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SARM1Q6SZW1 724 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 TMC7Q7Z402 723 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GAS2L3Q86XJ1 694 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 DENND6AQ8IWF6 608 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 C7orf57Q8NEG2 295 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 RASGRP4Q8TDF6 673 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HDAC11Q96DB2 347 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PHF20Q9BVI0 1012 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SPON1Q9HCB6 807 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 CNGB3Q9NQW8 809 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GDAP2Q9NXN4 497 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 UBA2Q9UBT2 640 aaPredicted RBP9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ASIC3Q9UHC3 531 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PSME2Q9UL46 239 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 STON1Q9Y6Q2 735 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.2□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 ZNF536O15090 1300 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 A0A1W2PNR3 127 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 HEATR9A2RTY3 570 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 SYCE1LA8MT33 242 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 B4E171 279 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 M0R3H8 397 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 GPR25O00155 361 aa9.19□□□□□ -0.94
RABGGTB-214ENST00000497648 PMM2O15305 246 aa9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.3 ms