RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472427.5

RALGPS1-212, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2

Gene RALGPS1, Length 764 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-212ENST00000472427 VDRP11473 427 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 ADORA2BP29275 332 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 KCNQ1P51787 676 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 STILQ15468 1287 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 DDR2Q16832 855 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 FUKQ8N0W3 1084 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 PSMG2Q969U7 264 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 C8orf48Q96LL4 319 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 LPIN3Q9BQK8 851 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 HESX1Q9UBX0 185 aa23.08■■□□□ 1.29
RALGPS1-212ENST00000472427 BRWD1Q9NSI6 2320 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A1B0GTH6 734 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 UCHL3P15374 230 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ATF6P18850 670 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 UBASH3AP57075 661 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GIPC2Q8TF65 315 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SPATA17Q96L03 361 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CEP72Q9P209 647 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NR2E1Q9Y466 385 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 COL6A3P12111 3177 aa23.07■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CBFA2T2O43439 604 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MED7O43513 233 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 RHOP08100 348 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 FSHRP23945 695 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 APBA1Q02410 837 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 TJAP1Q5JTD0 557 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP17Q68EM7 881 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SHC3Q92529 594 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SPAG5Q96R06 1193 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 POMKQ9H5K3 350 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PRKAG3Q9UGI9 489 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CNTN6Q9UQ52 1028 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SIK3Q9Y2K2 1263 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 FHOD1Q9Y613 1164 aa23.06■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 A0A1W2PQC6 194 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 F8VP50 259 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MYL4P12829 197 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 IL9P15248 144 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR15P49685 360 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ZNF132P52740 706 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 BPIFB4P59827 614 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 STK33Q9BYT3 514 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PTPRDP23468 1912 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 C2orf16Q68DN1 1984 aa23.05■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SLC38A8A6NNN8 435 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NPR3P17342 541 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PTK2Q05397 1052 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 OTOP3Q7RTS5 596 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 TDRD5Q8NAT2 981 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GPR152Q8TDT2 470 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GANQ9H2C0 597 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP23.04■■□□□ 1.281e-6■■■■□ 23.2
RALGPS1-212ENST00000472427 CDH22Q9UJ99 828 aa23.04■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 TEX33O43247 280 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NOL4O94818 638 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 CDC25CP30307 473 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GNA15P30679 374 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 KLK7P49862 253 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 BCAT1P54687 386 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MAP3K7CLP57077 242 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 SDHAF4Q5VUM1 108 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PAQR9Q6ZVX9 377 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ANKRD52Q8NB46 1076 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 DUSP16Q9BY84 665 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PNPLA8Q9NP80 782 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 IFNKQ9P0W0 207 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 TSPAN16Q9UKR8 245 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 USTQ9Y2C2 406 aa23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 THAP12O43422 761 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 MICAL2O94851 1124 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 EPHA5P54756 1037 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NTHL1P78549 312 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NR1I3Q14994 352 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 ADHFE1Q8IWW8 467 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NUP93Q8N1F7 819 aa23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
RALGPS1-212ENST00000472427 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.8 ms