RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438413.5

MUC1-211, Transcript of mucin 1, cell surface associated, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MUC1, Length 927 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC1-211ENST00000438413 PCSK1P29120 753 aa20.51■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 ALCAMQ13740 583 aa20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 DMC1Q14565 340 aa20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 EML3Q32P44 896 aa20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 N4BP2L1Q5TBK1 243 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 ACDQ96AP0 544 aa20.51■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 SIX4Q9UIU6 781 aa20.51■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 SH3RF2Q8TEC5 729 aa20.5■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa20.5■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.47■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 NUP205Q92621 2012 aa20.47■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 PANK2Q9BZ23 570 aa20.46■□□□□ 0.87
MUC1-211ENST00000438413 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.46■□□□□ 0.87
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MUC1-211ENST00000438413 BDNFP23560 247 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 ANXA13P27216 316 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 USP46P62068 366 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 SHC2P98077 582 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 CYP27A1Q02318 531 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 RESTQ13127 1097 aa20.45■□□□□ 0.86
MUC1-211ENST00000438413 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
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