RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409088.3

LRRTM4-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM4, Length 3,616 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-201ENST00000409088 OSBPL8Q9BZF1 889 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM204AQ9H8W3 233 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SPC25Q9HBM1 224 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CHST7Q9NS84 486 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PCYOX1Q9UHG3 505 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TSPAN16Q9UKR8 245 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 STRIP2Q9ULQ0 834 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 KRT10P13645 584 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PSMA2P25787 234 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 AXLP30530 894 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 CYP1B1Q16678 543 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MFSD7Q6UXD7 560 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 NME8Q8N427 588 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR2W6PQ8NHA6 318 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 EXD1Q8NHP7 514 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 MAIP1Q8WWC4 291 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 SEC14L1Q92503 715 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC45Q96CN5 670 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CCDC114Q96M63 670 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LPIN3Q9BQK8 851 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CENPHQ9H3R5 247 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 LRRC19Q9H756 370 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM49BQ9NUQ9 324 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PLAAQ9Y263 795 aa4.2□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa4.2□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 SIGLEC16A6NMB1 481 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 A8MXQ7 604 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 KRT1P04264 644 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6DP0CG33 693 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 RARBP10826 455 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CYBAP13498 195 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CYP3A5P20815 502 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MAN1A1P33908 653 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 HSD17B3P37058 310 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 LMAN1P49257 510 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FNTAP49354 379 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 VPS41P49754 854 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CDR1P51861 262 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 TAP1Q03518 808 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 SMTNL2Q2TAL5 461 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 KCNT1Q5JUK3 1230 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 UBXN11Q5T124 520 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 OR6B2Q6IFH4 312 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ALKAL1Q6UXT8 129 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 FAM228AQ86W67 206 aa4.19□□□□□ -1.74
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LRRTM4-201ENST00000409088 KATNAL2Q8IYT4 538 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 MREGQ8N565 214 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PIK3R5Q8WYR1 880 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ZWILCHQ9H900 591 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 CNTN3Q9P232 1028 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 WDR35Q9P2L0 1181 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 ASIC3Q9UHC3 531 aa4.19□□□□□ -1.74
LRRTM4-201ENST00000409088 PCSK1NQ9UHG2 260 aa4.19□□□□□ -1.74
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