RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376392.10

NME1-NME2-201, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 894 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-201ENST00000376392 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP13.71□□□□□ -0.21
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARHGEF37A1IGU5 675 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 KBTBD13C9JR72 458 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 E5RJQ4 531 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 F8VP50 259 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CYB561D2O14569 222 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RALAP11233 206 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCNN1AP37088 669 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CAP1Q01518 475 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 OGDHQ02218 1023 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DSC3Q14574 896 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LPIN1Q14693 890 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCNG2Q16589 344 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PKDCCQ504Y2 493 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DUPD1Q68J44 220 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 C12orf29Q8N999 325 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ANKRD52Q8NB46 1076 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 JOSD2Q8TAC2 188 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PKNOX2Q96KN3 472 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZFP42Q96MM3 310 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 UROC1Q96N76 676 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GAD1Q99259 594 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CNPY3Q9BT09 278 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DCLK3Q9C098 648 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RSAD1Q9HA92 442 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SAGE1Q9NXZ1 904 aa13.7□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRRD1A4D1F6 860 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ARL5CA6NH57 179 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPYSL4O14531 572 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPTLC1O15269 473 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PFKMP08237 780 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDGFRBP09619 1106 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ADORA2BP29275 332 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRK4P32298 578 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PCK1P35558 622 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LHX1P48742 406 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RGS7P49802 495 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM193AP78312 1265 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC6A3Q01959 620 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 GRIK3Q13003 919 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CALCOCO2Q13137 446 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TFDP3Q5H9I0 405 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DSTYKQ6XUX3 929 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TMEM110Q86TL2 294 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC30AQ86WT1 665 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ATL2Q8NHH9 583 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPATA18Q8TC71 538 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 C1orf54Q8WWF1 131 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SENP8Q96LD8 212 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 HSFY1Q96LI6 401 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC114Q96M63 670 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FMO2Q99518 471 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FRMD8P1Q9BZ68 369 aaPredicted RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRIM31Q9BZY9 425 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DPEP3Q9H4B8 488 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 STARD7Q9NQZ5 370 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF19AQ9NV58 838 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TJP2Q9UDY2 1190 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 EFR3BQ9Y2G0 817 aa13.69□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A0U1RQF3 1178 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 A0A1W2PQY0 241 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 NDC80O14777 642 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 LRCH4O75427 683 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FGFR1P11362 822 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ODC1P11926 461 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCDC130P13994 396 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDGFRAP16234 1089 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SDC4P31431 198 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 VEGFBP49765 207 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SCNN1GP51170 649 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 KRT17Q04695 432 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PDE4CQ08493 712 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 PTK6Q13882 451 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 SPDYCQ5MJ68 293 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 ZNF618Q5T7W0 954 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC27Q6P3X3 843 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 AGMOQ6ZNB7 445 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 METTL23Q86XA0 190 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 EMC1Q8N766 993 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 TTC13Q8NBP0 860 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 RNF169Q8NCN4 708 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 BBOF1Q8ND07 529 aa13.68□□□□□ -0.22
NME1-NME2-201ENST00000376392 CCHCR1Q8TD31 782 aa13.68□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.8 ms