RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358813.4

CCL20-201, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 800 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-201ENST00000358813 PFKPQ01813 784 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAP3K12Q12852 859 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TARDBPQ13148 414 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SNAPC2Q13487 334 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 C1orf122Q6ZSJ8 110 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MRGPRX1Q96LB2 322 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ABCC12Q96J65 1359 aa6.31□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PRSS47A8MTI9 375 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LGALS16A8MUM7 142 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 EYA2O00167 538 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 NPC1O15118 1278 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 THAP12O43422 761 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ANXA2P07355 339 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ADSLP30566 484 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MC3RP41968 323 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ITGA8P53708 1063 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PER3P56645 1201 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TLE1Q04724 770 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KIAA2012Q0VF49 1180 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TAF5Q15542 800 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CRY2Q49AN0 593 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 VASNQ6EMK4 673 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TEPPQ6URK8 271 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OR6B3Q8NGW1 331 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC30A5Q8TAD4 765 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RAB24Q969Q5 203 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 DYDC2Q96IM9 177 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAM167BQ9BTA0 163 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OSBPL6Q9BZF3 934 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HAPLN2Q9GZV7 340 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SMC4Q9NTJ3 1288 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 GGA3Q9NZ52 723 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 COL20A1Q9P218 1284 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 POLG2Q9UHN1 485 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 UBR2Q8IWV8 1755 aa6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 A0A1W2PR48 441 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ADM5C9JUS6 153 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 hCG_1984214I3L0E3 225 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ACKR2O00590 384 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 KCNQ3O43525 872 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TBC1D4O60343 1298 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TMEM127O75204 238 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FSBPO95073 299 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ATF2P15336 505 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ELF1P32519 619 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SERPINF1P36955 418 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 LIMS1P48059 325 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FKBP1BP68106 108 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 JAG1P78504 1218 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ARHGEF6Q15052 776 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 HLFQ16534 295 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FLYWCH1Q4VC44 716 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC44A4Q53GD3 710 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 C19orf54Q5BKX5 351 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 C3orf38Q5JPI3 329 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 VPS53Q5VIR6 699 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FAM180BQ6P0A1 224 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MCM10Q7L590 875 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 MIB1Q86YT6 1006 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TMEFF1Q8IYR6 380 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 IFI44Q8TCB0 444 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 DDX11Q96FC9 970 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SNX22Q96L94 193 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SORBS1Q9BX66 1292 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 DBNDD1Q9H9R9 158 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SLC13A4Q9UKG4 626 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.29□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 ABCC4O15439 1325 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 RIC1Q4ADV7 1423 aa6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
CCL20-201ENST00000358813 CCER2I3L3R5 266 aa6.28□□□□□ -1.4
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