RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000330687.8

CMTM4-201, Transcript of CKLF like MARVEL transmembrane domain containing 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CMTM4, Length 3,414 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM4-201ENST00000330687 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ANO5Q75V66 913 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PLEKHO2Q8TD55 490 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 KIFC3Q9BVG8 833 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LYPLA1O75608 230 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TFAP2AP05549 437 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MFSD14BQ5SR56 506 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 XXYLT1Q8NBI6 393 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TEKT1Q969V4 418 aa21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.5■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 BCL9O00512 1426 aa21.5■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 CLK2P49760 499 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PSMD6Q15008 389 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 METTL25Q8N6Q8 603 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 A0A1B0GTW7 788 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TM9SF1O15321 606 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 SLC16A4O15374 487 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LIASO43766 372 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 AVILO75366 819 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 CFHP08603 1231 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 OASLQ15646 514 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 KCNT1Q5JUK3 1230 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MCOLN2Q8IZK6 566 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PDIK1LQ8N165 341 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ATP8B3O60423 1300 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PLCH1Q4KWH8 1693 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ALOX15BO15296 676 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 XPNPEP1Q9NQW7 623 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 BTG4Q9NY30 223 aa21.49■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TAF1P21675 1872 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 PIK3R2O00459 728 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TRMUO75648 421 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TCP10Q12799 353 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 C1orf186Q6ZWK4 172 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TMC7Q7Z402 723 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LRGUKQ96M69 825 aa21.48■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 SLITRK3O94933 977 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 POLR2MP0CAP2 368 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LMNB2Q03252 620 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 KLHL38Q2WGJ6 581 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 GAB3Q8WWW8 586 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 GPRC5CQ9NQ84 441 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MAP3K6O95382 1288 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MRPS22P82650 360 aaKnown RBP21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MTA1Q13330 715 aa21.48■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 RNF169Q8NCN4 708 aa21.48■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 A0A088AWK7 358 aa21.47■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 VIL1P09327 827 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 FDFT1P37268 417 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ALDH1A3P47895 512 aa21.47■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 FAXCQ5TGI0 409 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LIN9Q5TKA1 542 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa21.47■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 ELK3P41970 407 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 NFIXQ14938 502 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 EFHC2Q5JST6 749 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MROH9Q5TGP6 573 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 SYDE2Q5VT97 1194 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 GIPC3Q8TF64 312 aa21.47■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 DOCK2Q92608 1830 aa21.47■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 ZNF394Q53GI3 561 aa21.46■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 LRRN4Q8WUT4 740 aa21.46■■□□□ 1.03
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CMTM4-201ENST00000330687 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 CAAP1Q9H8G2 361 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 UBAP1Q9NZ09 502 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 WEE2P0C1S8 567 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 COPAP53621 1224 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 LPIN1Q14693 890 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MORF4L2Q15014 288 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 NRF1Q16656 503 aa21.46■■□□□ 1.03
CMTM4-201ENST00000330687 MAP7D1Q3KQU3 841 aa21.46■■□□□ 1.03
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