RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 GOLGA8TH3BQL2 631 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SOAT2O75908 522 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 RALBP11234 206 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM62Q0P6H9 643 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 BOLA3Q53S33 107 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 NCAM1P13591 858 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SERPINB8P50452 374 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC44A4Q53GD3 710 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 STRIP1Q5VSL9 837 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC18P0CG32 403 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 IRF1P10914 325 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC6Q86X45 466 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNH7Q9NS40 1196 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DLGAP3O95886 979 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 GH1P01241 217 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ARHGEF7Q14155 803 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 LRRC71Q8N4P6 559 aa25.07■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 H3BQF6 201 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PGK2P07205 417 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMC3P17980 439 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CALB2P22676 271 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 WASHC5Q12768 1159 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS37AQ8NEZ2 397 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC38A7Q9NVC3 462 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 USE1Q9NZ43 259 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ADRM1Q16186 407 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 AGAP9Q5VTM2 703 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC103Q8IW40 242 aa25.06■■□□□ 1.6
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GNPTAB-201ENST00000299314 BRD8Q9H0E9 1235 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TULP4Q9NRJ4 1543 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TNS3Q68CZ2 1445 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ANXA9O76027 345 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PSMD7P51665 324 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TMEM120AQ9BXJ8 343 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 E7ENQ6 273 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB12Q6NXP0 572 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP8B4Q8TF62 1192 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 NDUFA13Q9P0J0 144 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TAGLN3Q9UI15 199 aa25.06■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ENTPD3O75355 529 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 FAR2Q96K12 515 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SEPT5Q99719 369 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 EFCAB1Q9HAE3 211 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF34Q8IZ26 560 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ELP3Q9H9T3 547 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KRT87PA6NCN2 255 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF103O00237 685 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PDE5AO76074 875 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGB3P05106 788 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CTSHP09668 335 aa25.05■■□□□ 1.6
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GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 STRNO43815 780 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ALDH1A1P00352 501 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP11B2P19099 503 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 MLH1P40692 756 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 IER5Q5VY09 327 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SH3GL2Q99962 352 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 GPR63Q9BZJ6 419 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KCTD10Q9H3F6 313 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DENND1BQ6P3S1 775 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa25.05■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 MSH4O15457 936 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ITGA4P13612 1032 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF23P17027 643 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SNX13Q9Y5W8 968 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 AQP5P55064 265 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PAFAH2Q99487 392 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KLHL4Q9C0H6 718 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ST8SIA6P61647 398 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TFDP3Q5H9I0 405 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CAVIN3Q969G5 261 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DCLRE1BQ9H816 532 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 HHIPL2Q6UWX4 724 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 UNC45BQ8IWX7 931 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 TUBGCP3Q96CW5 907 aa25.04■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 C19orf81C9J6K1 198 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ATP6V1G2O95670 118 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PCSK1P29120 753 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 NUP107P57740 925 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF280CQ8ND82 737 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 VWA5AO00534 786 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SUPT7LO94864 414 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
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