RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000298282.13

PKNOX2-201, Transcript of PBX/knotted 1 homeobox 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKNOX2, Length 3,687 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2-201ENST00000298282 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 RHOT1Q8IXI2 618 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 CNOT10Q9H9A5 744 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 RMI1Q9H9A7 625 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 PARVAQ9NVD7 372 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 TNFSF13BQ9Y275 285 aa11.21□□□□□ -0.61
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM191CA6NGB0 347 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 UNC5CO95185 931 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PRKCBP05771 671 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM191BP0C7N4 346 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 UBTFL6P0CB48 400 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZCCHC18P0CG32 403 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ADCY1Q08828 1119 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RCN2Q14257 317 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CCNG2Q16589 344 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MAPK6Q16659 721 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 DUOXA2Q1HG44 320 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MFSD5Q6N075 450 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TMEM270Q6UE05 265 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CXorf38Q8TB03 319 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC35B4Q969S0 331 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 FAM84AQ96KN4 292 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 BCO2Q9BYV7 579 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TRIM7Q9C029 511 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ELP3Q9H9T3 547 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SNX24Q9Y343 169 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 COL1A2P08123 1366 aa11.21□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MAGEB3O15480 346 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SORBS3O60504 671 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 POTEJP0CG39 1038 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TNFSF9P41273 254 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 Q3C1V9 767 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 VSTM1Q6UX27 236 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 HOOK3Q86VS8 718 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 FEZF2Q8TBJ5 459 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 GRK7Q8WTQ7 553 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ELMO3Q96BJ8 720 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 OPTNQ96CV9 577 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CDCA5Q96FF9 252 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LHX5Q9H2C1 402 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 IP6K2Q9UHH9 426 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 EVPLQ92817 2033 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TCEA3O75764 348 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 IL18RAPO95256 599 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CALCAP01258 141 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CALB1P05937 261 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 FGFR4P22455 802 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PSMC4P43686 418 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MBTD1Q05BQ5 628 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TFDP1Q14186 410 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SPOCK2Q92563 424 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 GATA6Q92908 595 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ROPN1BQ9BZX4 212 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ROPN1Q9HAT0 212 aaPredicted RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RXFP1Q9HBX9 757 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 AAASQ9NRG9 546 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 OSBPP22059 807 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ASPAP45381 313 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ERFP50548 548 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CCDC142Q17RM4 750 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF484Q5JVG2 852 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ARL10Q8N8L6 244 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ENDOVQ8N8Q3 282 aaKnown RBP11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CLMNQ96JQ2 1002 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 MMP19Q99542 508 aa11.2□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 A6NJR5 290 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PDLIM1O00151 329 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CREB3O43889 395 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 WFS1O76024 890 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 CBX6O95503 412 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 C22orf31O95567 290 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 PLTPP55058 493 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 SCARA3Q6AZY7 606 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 OTUD5Q96G74 571 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ASB14A6NK59 587 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 RIPK2O43353 540 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 STAU1O95793 577 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 TAS2R40P59535 323 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa11.19□□□□□ -0.62
PKNOX2-201ENST00000298282 AUHQ13825 339 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.7 ms