RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295927.3

PTX3-201, Transcript of pentraxin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTX3, Length 1,940 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3-201ENST00000295927 CCDC188H7C350 402 aa24.08■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 COL6A1P12109 1028 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 PAX3P23760 479 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 VSNL1P62760 191 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 WDR93Q6P2C0 686 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 KLHL7Q8IXQ5 586 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 FUKQ8N0W3 1084 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 FNIP1Q8TF40 1166 aa24.08■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 DIS3LQ8TF46 1054 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 CCL23P55773 120 aa24.07■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 COLGALT2Q8IYK4 626 aa24.05■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 KATNAL2Q8IYT4 538 aa24.05■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 RTP3Q9BQQ7 232 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 MYBPHLA2RUH7 354 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 PLA2G4AP47712 749 aa24.04■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 PARNO95453 639 aaKnown RBP24.03■■□□□ 1.44
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PTX3-201ENST00000295927 LRFN2Q9ULH4 789 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa24.03■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa24.02■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 C2CD4BA6NLJ0 364 aa24.02■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 LRCH4O75427 683 aa24.02■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 GRAP2O75791 330 aa24.02■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 NPR3P17342 541 aa24.02■■□□□ 1.44
PTX3-201ENST00000295927 GPD1P21695 349 aa24.02■■□□□ 1.44
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