RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285679.10

USP25-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP25, Length 3,973 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-201ENST00000285679 APPL1Q9UKG1 709 aa15.99■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ACTL7BQ9Y614 415 aa15.99■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CYB561D2O14569 222 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 FDX1P10109 184 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DAW1Q8N136 415 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 OPTNQ96CV9 577 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 LRGUKQ96M69 825 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC24A2Q9UI40 661 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 GRID1Q9ULK0 1009 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 AIM2O14862 343 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 IL1R1P14778 569 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DSG3P32926 999 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 MAMLD1Q13495 774 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 POLNQ7Z5Q5 900 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PTPRN2Q92932 1015 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 MPP4Q96JB8 637 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CNBD2Q96M20 576 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 MAP3K13O43283 966 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 T-ENOLP0DO92 83 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ANPEPP15144 967 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CCNFP41002 786 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CNGA3Q16281 694 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TRIM42Q8IWZ5 723 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 OLFM3Q96PB7 478 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZNF341Q9BYN7 854 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DMAC2Q9NW81 257 aa15.98■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 KRT38O76015 456 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 LYNP07948 512 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 OR6B2Q6IFH4 312 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 C16orf46Q6P387 395 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 AMIGO3Q86WK7 504 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 KCND2Q9NZV8 630 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 LGALS13Q9UHV8 139 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CYP24A1Q07973 514 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 BST1Q10588 318 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 NCOA4Q13772 614 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TMPRSS6Q8IU80 811 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP18Q8N392 663 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 IL31RAQ8NI17 732 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 HELQQ8TDG4 1101 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CACNA1SQ13698 1873 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 NPTXRO95502 500 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 RPL10AP62906 217 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ROR1Q01973 937 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PEX6Q13608 980 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 LMO3Q8TAP4 145 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CD101Q93033 1021 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DNAJC1Q96KC8 554 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 EPAS1Q99814 870 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 FOXP3Q9BZS1 431 aa15.97■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 A6NHS1 94 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC26A4O43511 780 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PROCP04070 461 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 GNAZP19086 355 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ARHGAP8P85298 464 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CUL2Q13617 745 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SLC27A3Q5K4L6 730 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 FNBP1LQ5T0N5 605 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 TRIML2Q8N7C3 387 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CALB1P05937 261 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DNAL1Q4LDG9 190 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 SH2D4BQ5SQS7 431 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 WDR35Q9P2L0 1181 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 KCNA4P22459 653 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 IVDP26440 423 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 DLGAP5Q15398 846 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 ZNF212Q9UDV6 495 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 GAKO14976 1311 aa15.96■□□□□ 0.15
USP25-201ENST00000285679 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 ITGB5P18084 799 aa15.95■□□□□ 0.14
USP25-201ENST00000285679 CIITAP33076 1130 aa15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.6 ms