RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000285199.11

USP43-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 43, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP43, Length 4,169 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43-201ENST00000285199 NR3C2P08235 984 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CHRNA5P30532 468 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CRADDP78560 199 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZDHHC24Q6UX98 284 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 RASGEF1CQ8N431 466 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TASP1Q9H6P5 420 aa16.36■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 KPNA7A9QM74 516 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TFE3P19532 575 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 DRG2P55039 364 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 NME5P56597 212 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 FAM160B1Q5W0V3 765 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TTC7BQ86TV6 843 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZNF606Q8WXB4 792 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZNF570Q96NI8 536 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GRIP2Q9C0E4 1043 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 MAN1C1Q9NR34 630 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 EFHC1Q5JVL4 640 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 DCAF12L1Q5VU92 463 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PIGWQ7Z7B1 504 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 EXD1Q8NHP7 514 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GDPD5Q8WTR4 605 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 OPTNQ96CV9 577 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CMTM5Q96DZ9 223 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ARHGAP23Q9P227 1491 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 P4HA2O15460 535 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 VCPP55072 806 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PKNOX1P55347 436 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GRM1Q13255 1194 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ITGA9Q13797 1035 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 OASLQ15646 514 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 AMHR2Q16671 573 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TMPRSS6Q8IU80 811 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CYGBQ8WWM9 190 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SEMA4DQ92854 862 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 KCNK16Q96T55 309 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 FOXP3Q9BZS1 431 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CHKBQ9Y259 395 aa16.35■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 DGAT1O75907 488 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CDH8P55286 799 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 MYL6P60660 151 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ATP6V1E2Q96A05 226 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SNX25Q9H3E2 840 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 KCNMB3Q9NPA1 279 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TAGLN3Q9UI15 199 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 WASF2Q9Y6W5 498 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PTK6Q13882 451 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 RNF43Q68DV7 783 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PTAR1Q7Z6K3 402 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 TRABD2AQ86V40 505 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SDCCAG3Q96C92 435 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GRID1Q9ULK0 1009 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 NUB1Q9Y5A7 615 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SNX13Q9Y5W8 968 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 RAG1P15918 1043 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 AVPR1AP37288 418 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PLIN5Q00G26 463 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PTF1AQ7RTS3 328 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SEPT12Q8IYM1 358 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GSTCDQ8NEC7 633 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZNF669Q96BR6 464 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 FAM136AQ96C01 138 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 FEM1BQ9UK73 627 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 STARD13Q9Y3M8 1113 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SNX9Q9Y5X1 595 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 GOLGA8TH3BQL2 631 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PSTPIP1O43586 416 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 EDF1O60869 148 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 BLMHQ13867 455 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 PDK4Q16654 411 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SLC45A4Q5BKX6 768 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 RIPOR1Q6ZS17 1223 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CLNKQ7Z7G1 428 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 MRPL1Q9BYD6 325 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 NMUR2Q9GZQ4 415 aa16.34■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 H0YGN5 161 aa16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 KLHL2O95198 593 aa16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 SFNP31947 248 aa16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 RHBDL3P58872 404 aa16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 CDK16Q00536 496 aa16.33■□□□□ 0.21
USP43-201ENST00000285199 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms