RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219302.7

NME3-201, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NME3, Length 1,069 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-201ENST00000219302 ATP2C2O75185 946 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 LMO2P25791 158 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PCSK1P29120 753 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MPLP40238 635 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ZXDBP98169 803 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CUL4AQ13619 759 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 DMC1Q14565 340 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 DPH6Q7L8W6 267 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ADGRF2Q8IZF7 708 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SH3RF2Q8TEC5 729 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ATP2A3Q93084 1043 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 EXOC4Q96A65 974 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PCIF1Q9H4Z3 704 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TRPC7Q9HCX4 862 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 VPS45Q9NRW7 570 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ANAPC1Q9H1A4 1944 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 USP24Q9UPU5 2620 aa16.89■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ABCA7Q8IZY2 2146 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 A0A087X0B3 334 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 DCLK1O15075 740 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 APBB3O95704 486 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CKMP06732 381 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KRT19P08727 400 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 IDEP14735 1019 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 HDCP19113 662 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 IFNAR2P48551 515 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SHC2P98077 582 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ALCAMQ13740 583 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 FAM173BQ6P4H8 233 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SCN4BQ8IWT1 228 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 OR5B17Q8NGF7 314 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SPATA17Q96L03 361 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MTMR12Q9C0I1 747 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CRTAC1Q9NQ79 661 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PANK4Q9NVE7 773 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 INTS13Q9NVM9 706 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PTPRJQ12913 1337 aa16.88■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ANTXRLA6NF34 631 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 RESTQ13127 1097 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 GAB4Q2WGN9 574 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TCEAL6Q6IPX3 200 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 VSTM1Q6UX27 236 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 GPD1LQ8N335 351 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 FSIP1Q8NA03 581 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TCEAL3Q969E4 200 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ACDQ96AP0 544 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 HPDLQ96IR7 371 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CHAMP1Q96JM3 812 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CEP295NLQ96MC4 621 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PANK2Q9BZ23 570 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CDH9Q9ULB4 789 aa16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP16.87■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 K7EQS6 105 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 RHOBTB1O94844 696 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TMEM191BP0C7N4 346 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PFKLP17858 780 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KCNA4P22459 653 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 OPRD1P41143 372 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 USP46P62068 366 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 NR1H3Q13133 447 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TTC16Q8NEE8 873 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 USP33Q8TEY7 942 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 SYT15Q9BQS2 421 aa16.86■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ZNF233A6NK53 670 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KCNK5O95279 499 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PDGFRBP09619 1106 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 WARSP23381 471 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 BDNFP23560 247 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 HOXD13P35453 343 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 TXLNAP40222 546 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MYO1EQ12965 1108 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 PSMD2Q13200 908 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KCNB1Q14721 858 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ELF2Q15723 593 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 DUOXA2Q1HG44 320 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 RNF43Q68DV7 783 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 RASSF3Q86WH2 238 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 CBWD2Q8IUF1 395 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 KIAA1958Q8N8K9 716 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 GLIS3Q8NEA6 775 aa16.85■□□□□ 0.29
NME3-201ENST00000219302 MYLPFQ96A32 169 aa16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20 ms